RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546621.5

CS-204, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-204ENST00000546621 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 DGAT1O75907 488 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 TGFB3P10600 412 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 SMTNP53814 917 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 ERVK-9P63128 1117 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 KCTD2Q14681 263 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 EXOC3L4Q17RC7 722 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 SFMBT2Q5VUG0 894 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 ZNF662Q6ZS27 426 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 C12orf56Q8IXR9 622 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 C3orf20Q8ND61 904 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 SPIRE2Q8WWL2 714 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 CCDC42Q96M95 316 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 FGD4Q96M96 766 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 MMP19Q99542 508 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 MROH8Q9H579 483 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 HAUS4Q9H6D7 363 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 RMI1Q9H9A7 625 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 ZNF408Q9H9D4 720 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 NLRC4Q9NPP4 1024 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 ZNF302Q9NR11 478 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 PDLIM7Q9NR12 457 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 CYP26B1Q9NR63 512 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 MYO1AQ9UBC5 1043 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 RAB21Q9UL25 225 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 CCDC169A6NNP5 214 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 SLC16A4O15374 487 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 EXOC3O60645 756 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 URI1O94763 535 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 OATP04181 439 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 SERPING1P05155 500 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 PGK2P07205 417 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 ACTN1P12814 892 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 SLC9A1P19634 815 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 PON1P27169 355 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 NPTX2P47972 431 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP8.4□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 RTP1P59025 263 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 FKBP1BP68106 108 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 DEUP1Q05D60 604 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 CCDC38Q502W7 563 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 MAP4K3Q8IVH8 894 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 SHCBP1Q8NEM2 672 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 FAM81AQ8TBF8 368 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 AFAP1L1Q8TED9 768 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 C17orf50Q8WW18 174 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 GOLGA1Q92805 767 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 TRIM7Q9C029 511 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 KIF9Q9HAQ2 790 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 KMT5AQ9NQR1 393 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 AIPL1Q9NZN9 384 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 GCNT4Q9P109 453 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 FBXL5Q9UKA1 691 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 TBX20Q9UMR3 447 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 EXOC7Q9UPT5 735 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 LCA5LO95447 670 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 ECEL1O95672 775 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 ABL1P00519 1130 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 CETPP11597 493 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 KRT13P13646 458 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 UCHL3P15374 230 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 ATP4AP20648 1035 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 PEX19P40855 299 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 FMO5P49326 533 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 GTF2A2P52657 109 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 KIF11P52732 1056 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 VAV2P52735 878 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 APBA1Q02410 837 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 IFFO1Q0D2I5 559 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 BFSP1Q12934 665 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 LAMB3Q13751 1172 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 RAPGEF1Q13905 1077 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 SPA17Q15506 151 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
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