RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544612.5

ANKRD49-210, Transcript of ankyrin repeat domain 49, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD49, Length 2,268 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD49-210ENST00000544612 SDR42E1Q8WUS8 393 aa13.78□□□□□ -0.2
ANKRD49-210ENST00000544612 MIS12Q9H081 205 aa13.78□□□□□ -0.2
ANKRD49-210ENST00000544612 ERVK-5Q9HDB9 667 aa13.78□□□□□ -0.2
ANKRD49-210ENST00000544612 KCNK9Q9NPC2 374 aa13.78□□□□□ -0.2
ANKRD49-210ENST00000544612 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
ANKRD49-210ENST00000544612 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa13.78□□□□□ -0.2
ANKRD49-210ENST00000544612 BLOC1S6Q9UL45 172 aa13.78□□□□□ -0.2
ANKRD49-210ENST00000544612 CHKBQ9Y259 395 aa13.78□□□□□ -0.2
ANKRD49-210ENST00000544612 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP13.78□□□□□ -0.2
ANKRD49-210ENST00000544612 PFASO15067 1338 aa13.78□□□□□ -0.2
ANKRD49-210ENST00000544612 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
ANKRD49-210ENST00000544612 WDR90Q96KV7 1748 aa13.78□□□□□ -0.2
ANKRD49-210ENST00000544612 A0A1B0GUL6 1792 aa13.78□□□□□ -0.2
ANKRD49-210ENST00000544612 T-ENOLP0DO92 83 aa13.78□□□□□ -0.2
ANKRD49-210ENST00000544612 BRAFP15056 766 aa13.78□□□□□ -0.2
ANKRD49-210ENST00000544612 UCHL3P15374 230 aa13.78□□□□□ -0.2
ANKRD49-210ENST00000544612 TARSP26639 723 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
ANKRD49-210ENST00000544612 TECP42680 631 aa13.78□□□□□ -0.2
ANKRD49-210ENST00000544612 IL9RQ01113 521 aa13.78□□□□□ -0.2
ANKRD49-210ENST00000544612 CCDC6Q16204 474 aa13.78□□□□□ -0.2
ANKRD49-210ENST00000544612 PTPROQ16827 1216 aa13.78□□□□□ -0.2
ANKRD49-210ENST00000544612 C4orf50Q6ZRC1 276 aa13.78□□□□□ -0.2
ANKRD49-210ENST00000544612 NELFCDQ8IXH7 590 aa13.78□□□□□ -0.2
ANKRD49-210ENST00000544612 PPFIBP2Q8ND30 876 aa13.78□□□□□ -0.2
ANKRD49-210ENST00000544612 TTC8Q8TAM2 541 aa13.78□□□□□ -0.2
ANKRD49-210ENST00000544612 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
ANKRD49-210ENST00000544612 SPATA16Q9BXB7 569 aa13.78□□□□□ -0.2
ANKRD49-210ENST00000544612 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
ANKRD49-210ENST00000544612 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa13.78□□□□□ -0.2
ANKRD49-210ENST00000544612 SAR1AQ9NR31 198 aa13.78□□□□□ -0.2
ANKRD49-210ENST00000544612 CIDEBQ9UHD4 219 aa13.78□□□□□ -0.2
ANKRD49-210ENST00000544612 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa13.77□□□□□ -0.2
ANKRD49-210ENST00000544612 PCNTO95613 3336 aa13.77□□□□□ -0.2
ANKRD49-210ENST00000544612 SMAPO00193 183 aa13.77□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 RIMBP2O15034 1052 aa13.77□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 ENTPD5O75356 428 aa13.77□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 TMEM253P0C7T8 217 aa13.77□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 CYP7A1P22680 504 aa13.77□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 CTNNA2P26232 953 aa13.77□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 NT5C2P49902 561 aa13.77□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 SLC34A1Q06495 639 aa13.77□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 AP1B1Q10567 949 aa13.77□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 KCNH2Q12809 1159 aa13.77□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 LSAMPQ13449 338 aa13.77□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 CNPY1Q3B7I2 92 aa13.77□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa13.77□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa13.77□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 RGS9BPQ6ZS82 235 aa13.77□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 DYMQ7RTS9 669 aa13.77□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 ANKRD23Q86SG2 305 aa13.77□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 ANKRD42Q8N9B4 389 aa13.77□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 RFFLQ8WZ73 363 aa13.77□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 RAD54LQ92698 747 aa13.77□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP13.77□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 PNMA5Q96PV4 448 aa13.77□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa13.77□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 LRP2BPQ9P2M1 347 aa13.77□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa13.77□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 SCN9AQ15858 1988 aa13.77□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 H0Y3Z8 333 aa13.76□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 FZD9O00144 591 aa13.76□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 VCAM1P19320 739 aa13.76□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 EPHB2P29323 1055 aa13.76□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 SERPINB4P48594 390 aa13.76□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 C1QTNF8P60827 252 aa13.76□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 MOGSQ13724 837 aa13.76□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 LONRF1Q17RB8 773 aa13.76□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 SH2D4BQ5SQS7 431 aa13.76□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 DDX12PQ92771 950 aa13.76□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa13.76□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 BARHL2Q9NY43 387 aa13.76□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 LGALS13Q9UHV8 139 aa13.76□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa13.76□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 C6orf229H3BNL8 230 aa13.76□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP13.76□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 CREB1P16220 341 aa13.76□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP13.76□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 GALCP54803 685 aa13.76□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 MPP2Q14168 576 aa13.76□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP13.76□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 EDRF1Q3B7T1 1238 aa13.76□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 RASIP1Q5U651 963 aa13.76□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 EXOC8Q8IYI6 725 aa13.76□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 GDAP1Q8TB36 358 aa13.76□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 TUBB6Q9BUF5 446 aa13.76□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 GALNT8Q9NY28 637 aa13.76□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
ANKRD49-210ENST00000544612 CETN3O15182 167 aa13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms