RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 TBC1D8O95759 1140 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 ARL2P36404 184 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 LONRF2Q1L5Z9 754 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 MAP4K3Q8IVH8 894 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 ASAP3Q8TDY4 903 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 ATP8B4Q8TF62 1192 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 TLR10Q9BXR5 811 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 SIP14410 1827 aa21.95■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 EVI5O60447 810 aa21.95■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 MAFO75444 373 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 PALMO75781 387 aa21.95■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 CYP2B6P20813 491 aa21.95■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 MCM3P25205 808 aa21.95■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 DRP2Q13474 957 aa21.95■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 DUSP28Q4G0W2 176 aa21.95■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 WDR93Q6P2C0 686 aa21.95■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 NFRKBQ6P4R8 1299 aa21.95■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 COG1Q8WTW3 980 aa21.95■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM167AQ96KS9 214 aa21.95■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa21.95■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 DENND3A2RUS2 1198 aa21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 IGHA2P01877 340 aa21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 GLRA2P23416 452 aa21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 DLG4P78352 724 aa21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 ITIH3Q06033 890 aa21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 TAS1R3Q7RTX0 852 aa21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 PPTC7Q8NI37 304 aa21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 RNPEPQ9H4A4 650 aa21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 LGALS2P05162 132 aa21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 CYP2C19P33261 490 aa21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 RFC5P40937 340 aa21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 VSNL1P62760 191 aa21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 LMO3Q8TAP4 145 aa21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC7A3Q8WY07 619 aa21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 NENFQ9UMX5 172 aa21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 NCK2O43639 380 aa21.93■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC181Q5TID7 509 aa21.93■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 IQSEC1Q6DN90 963 aa21.93■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC70Q6NSX1 233 aa21.93■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa21.93■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa21.93■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 VTI1AQ96AJ9 217 aa21.93■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa21.93■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa21.93■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 INTUQ9ULD6 942 aa21.93■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 ANKRD63C9JTQ0 380 aa21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 CNGA1P29973 690 aa21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 PAFAH1B1P43034 410 aa21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 PPP3CAQ08209 521 aa21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 FUT8Q9BYC5 575 aa21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP21.92■■□□□ 1.15e-8■■□□□ 12.6
PACSIN3-211ENST00000539589 PMM2O15305 246 aa21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 H2AFZP0C0S5 128 aa21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 GCLMP48507 274 aa21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC26A2P50443 739 aa21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 H2AFVQ71UI9 128 aa21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 IFT74Q96LB3 600 aa21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 C16orf70Q9BSU1 422 aa21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 GPR88Q9GZN0 384 aa21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 ABCB6Q9NP58 842 aa21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 RNF14Q9UBS8 474 aa21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 KCNG1Q9UIX4 513 aa21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 KAT6AQ92794 2004 aa21.91■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa21.91■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 SASH3O75995 380 aa21.91■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 ADSSP30520 456 aa21.91■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 CXCR5P32302 372 aa21.91■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 ABCD1P33897 745 aa21.91■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 RGS2P41220 211 aa21.91■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 CAP1Q01518 475 aa21.91■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 C1orf220Q5T0J3 134 aa21.91■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC39A4Q6P5W5 647 aa21.91■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 ZBTB10Q96DT7 871 aa21.91■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 PSMB7Q99436 277 aa21.91■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 H0YCG3 227 aa21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF286BP0CG31 522 aa21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 PLA2G4AP47712 749 aa21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 TNFAIP2Q03169 654 aa21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 NOGQ13253 232 aa21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 ARHGAP44Q17R89 818 aa21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 DEFB115Q30KQ5 88 aa21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 EPC2Q52LR7 807 aa21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 MEI1Q5TIA1 1274 aa21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 OLFML2BQ68BL8 750 aa21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 MMGT1Q8N4V1 131 aa21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 OR6J1Q8NGC5 347 aa21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC30A5Q8TAD4 765 aa21.9■■□□□ 1.1
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