RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531466.1

PTPRK-220, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 311 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-220ENST00000531466 EFHBQ8N7U6 833 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 CHTF18Q8WVB6 975 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 LRFN3Q9BTN0 628 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 PRAMEF4O60810 478 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 GAS7O60861 476 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 ERBB2P04626 1255 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 RESTQ13127 1097 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 TFAP2CQ92754 450 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 NELL1Q92832 810 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 MS4A5Q9H3V2 200 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 PRSS38A1L453 326 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 B5MCH6 92 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 TGM5O43548 720 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 KPNA6O60684 536 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 ESRRBO95718 433 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 RBP3P10745 1247 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 ITGAMP11215 1152 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 GPR15P49685 360 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 ELLP55199 621 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 MPP3Q13368 585 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 PASD1Q8IV76 773 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 MDM1Q8TC05 714 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 NEU1Q99519 415 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 RNF181Q9P0P0 153 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 MARCH11A6NNE9 402 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 E9PSI1 815 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 F2P00734 622 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 C1RP00736 705 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 MGAT1P26572 445 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 MPLP40238 635 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 BLOC1S1P78537 153 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 DSG1Q02413 1049 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 EPHA10Q5JZY3 1008 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 SOGA3Q5TF21 947 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 GLB1L2Q8IW92 636 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 KANSL2Q9H9L4 492 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 TLK1Q9UKI8 766 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 TBKBP1A7MCY6 615 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 DDB1Q16531 1140 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 CCDC178Q5BJE1 867 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 METRNLQ641Q3 311 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 CEP95Q96GE4 821 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 PHACTR3Q96KR7 559 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 C8orf37Q96NL8 207 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 ORAI3Q9BRQ5 295 aa6.65□□□□□ -1.34
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PTPRK-220ENST00000531466 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-220ENST00000531466 SALL3Q9BXA9 1300 aa6.65□□□□□ -1.35
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PTPRK-220ENST00000531466 ITGA10O75578 1167 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 BMT2Q1RMZ1 405 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 ABHD15Q6UXT9 468 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 CAGE1Q8TC20 777 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 MTFR1LQ9H019 292 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 TMEM127O75204 238 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 ASMTLO95671 621 aa6.63□□□□□ -1.35
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PTPRK-220ENST00000531466 NEK4P51957 841 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 CHN2P52757 468 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 MXRA7P84157 204 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 KIF18BQ86Y91 864 aa6.63□□□□□ -1.35
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PTPRK-220ENST00000531466 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 MAST3O60307 1309 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 MYADML2A6NDP7 307 aa6.62□□□□□ -1.35
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PTPRK-220ENST00000531466 IGLV2-14P01704 120 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 CFIP05156 583 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 SCAPQ12770 1279 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 MFSD14BQ5SR56 506 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 LYSMD2Q8IV50 215 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 OSBPL2Q9H1P3 480 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 PRDM12Q9H4Q4 367 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 GPRC5DQ9NZD1 345 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 PRSS50Q9UI38 385 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 NUMBLQ9Y6R0 609 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 RFPL3O75679 317 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 FOSP01100 380 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
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