RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 TNFSF9P41273 254 aa24.83■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 EDRF1Q3B7T1 1238 aa24.83■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 UBXN11Q5T124 520 aa24.83■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 IRF2BP1Q8IU81 584 aa24.83■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 CBWD2Q8IUF1 395 aa24.83■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 DMAC2Q9NW81 257 aa24.83■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 SIP14410 1827 aa24.82■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 EXOC3O60645 756 aa24.82■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 MCL1Q07820 350 aa24.82■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP24.82■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 GOLGA5Q8TBA6 731 aa24.82■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 ADAM2Q99965 735 aa24.82■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 ATP1A3P13637 1013 aa24.82■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 USP38Q8NB14 1042 aa24.82■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 APOL6Q9BWW8 343 aa24.82■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 ACRP10323 421 aa24.81■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 GARTP22102 1010 aa24.81■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa24.81■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 SLFN12LQ6IEE8 588 aa24.81■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 LINC01599Q8WXQ3 324 aa24.81■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 HTATIP2Q9BUP3 242 aa24.81■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 RNF19AQ9NV58 838 aa24.81■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 SQORQ9Y6N5 450 aa24.81■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 N4BP3O15049 544 aa24.8■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 CETN3O15182 167 aa24.8■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM189A1O60320 539 aa24.8■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP24.8■■□□□ 1.566e-6■■■■■ 34.5
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC27A1Q6PCB7 646 aa24.8■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 XXYLT1Q8NBI6 393 aa24.8■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 BADQ92934 168 aa24.8■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM84AQ96KN4 292 aa24.8■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 RNF39Q9H2S5 420 aa24.8■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa24.8■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 IKBKBO14920 756 aa24.8■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 CAVIN2O95810 425 aa24.8■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 ADRB2P07550 413 aa24.8■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 RPL13P26373 211 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 DSC3Q14574 896 aa24.8■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 C12orf56Q8IXR9 622 aa24.8■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 SMTNL1A8MU46 457 aa24.79■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 AXLP30530 894 aa24.79■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 WNT7BP56706 349 aa24.79■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 MFSD5Q6N075 450 aa24.79■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 ADPGKQ9BRR6 497 aa24.79■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 CXCL16Q9H2A7 254 aa24.79■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 MEIS3P2A8K0S8 358 aa24.78■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 CXCL10P02778 98 aa24.78■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 AKAP5P24588 427 aa24.78■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC9A9Q8IVB4 645 aa24.78■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 GPD1LQ8N335 351 aa24.78■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 SNTG2Q9NY99 539 aa24.78■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa24.78■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 MCF2P10911 925 aa24.78■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 NFIL3Q16649 462 aa24.78■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 RNF169Q8NCN4 708 aa24.78■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 SEPT8Q92599 483 aa24.78■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 LPPQ93052 612 aa24.78■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa24.78■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa24.78■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 OGTO15294 1046 aa24.77■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 EXTL3O43909 919 aa24.77■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 STAG3L1P0CL83 205 aa24.77■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM186BQ8IYM0 893 aa24.77■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM212AQ96EL1 285 aa24.77■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 CHST12Q9NRB3 414 aa24.77■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM105AQ9NUU6 356 aa24.77■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 IPPQ9Y573 584 aa24.77■■□□□ 1.56
TSNARE1-208ENST00000524325 CDKAL1Q5VV42 579 aa24.76■■□□□ 1.55
TSNARE1-208ENST00000524325 PLEKHO2Q8TD55 490 aa24.76■■□□□ 1.55
TSNARE1-208ENST00000524325 CEP63Q96MT8 703 aa24.76■■□□□ 1.55
TSNARE1-208ENST00000524325 THAP9Q9H5L6 903 aa24.76■■□□□ 1.55
TSNARE1-208ENST00000524325 ALPK3Q96L96 1907 aa24.76■■□□□ 1.55
TSNARE1-208ENST00000524325 CXCL8P10145 99 aa24.76■■□□□ 1.55
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF18P17022 549 aa24.76■■□□□ 1.55
TSNARE1-208ENST00000524325 SPAG1Q07617 926 aa24.76■■□□□ 1.55
TSNARE1-208ENST00000524325 CCDC40Q4G0X9 1142 aa24.76■■□□□ 1.55
TSNARE1-208ENST00000524325 FOXR2Q6PJQ5 311 aa24.76■■□□□ 1.55
TSNARE1-208ENST00000524325 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa24.76■■□□□ 1.55
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM199Q8N511 208 aa24.76■■□□□ 1.55
TSNARE1-208ENST00000524325 CCDC127Q96BQ5 260 aa24.76■■□□□ 1.55
TSNARE1-208ENST00000524325 FBXL18Q96ME1 805 aa24.76■■□□□ 1.55
TSNARE1-208ENST00000524325 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
TSNARE1-208ENST00000524325 KLK14Q9P0G3 267 aa24.76■■□□□ 1.55
TSNARE1-208ENST00000524325 TET1Q8NFU7 2136 aa24.76■■□□□ 1.55
TSNARE1-208ENST00000524325 SCN5AQ14524 2016 aa24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms