RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524095.5

CLVS1-211, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 3

Gene CLVS1, Length 709 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-211ENST00000524095 MBOAT7Q96N66 472 aa8.26□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 KXD1Q9BQD3 176 aa8.26□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 MINDY3Q9H8M7 445 aa8.26□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 RSAD1Q9HA92 442 aa8.26□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 BARHL2Q9NY43 387 aa8.26□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa8.26□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 FRYQ5TBA9 3013 aa8.25□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 COL4A3Q01955 1670 aa8.25□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 ARL5CA6NH57 179 aa8.25□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 DDX11L8A8MPP1 907 aa8.25□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 WDR64B1ANS9 1081 aa8.25□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 NCAM2O15394 837 aa8.25□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 MSH4O15457 936 aa8.25□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 MAFO75444 373 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 NCLP19338 710 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 MCM5P33992 734 aa8.25□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 DNM2P50570 870 aa8.25□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 PFKPQ01813 784 aa8.25□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 ADCY1Q08828 1119 aa8.25□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 GSE1Q14687 1217 aa8.25□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 CSRP2Q16527 193 aa8.25□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 USP41Q3LFD5 358 aa8.25□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 MTERF2Q49AM1 385 aa8.25□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 LAIR1Q6GTX8 287 aa8.25□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 TANGO2Q6ICL3 276 aa8.25□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 PPP1R18Q6NYC8 613 aa8.25□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa8.25□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 ZNF852Q6ZMS4 543 aa8.25□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 PRR23CQ6ZRP0 262 aa8.25□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 TPRG1Q6ZUI0 275 aa8.25□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 ZNF410Q86VK4 478 aa8.25□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 SGMS1Q86VZ5 419 aa8.25□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 GPR65Q8IYL9 337 aa8.25□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 GSTCDQ8NEC7 633 aa8.25□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 GAD1Q99259 594 aa8.25□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 CLSTN3Q9BQT9 956 aa8.25□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 COLEC11Q9BWP8 271 aa8.25□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 UNC45AQ9H3U1 944 aa8.25□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 HEBP1Q9NRV9 189 aa8.25□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa8.25□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 ZZEF1O43149 2961 aa8.25□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 SPEGQ15772 3267 aa8.25□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 CCL16O15467 120 aa8.24□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 SGSM2O43147 1006 aa8.24□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 ADAM12O43184 909 aa8.24□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 LRP3O75074 770 aa8.24□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 PROS1P07225 676 aa8.24□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa8.24□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 HOXC13P31276 330 aa8.24□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 NRLP54845 237 aa8.24□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 DMWDQ09019 674 aa8.24□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 GAS6Q14393 721 aa8.24□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 XKR3Q5GH77 459 aa8.24□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 B3GNT9Q6UX72 402 aa8.24□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 ANO5Q75V66 913 aa8.24□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 MTSS1LQ765P7 747 aa8.24□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 MICU3Q86XE3 530 aa8.24□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 EXOC6Q8TAG9 804 aa8.24□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 SLC5A5Q92911 643 aa8.24□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 ZFP42Q96MM3 310 aa8.24□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 NLRP4Q96MN2 994 aa8.24□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 GLT8D2Q9H1C3 349 aa8.24□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 LMAN1LQ9HAT1 526 aa8.24□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP8.24□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 RXFP3Q9NSD7 469 aa8.24□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa8.24□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 BRPF3Q9ULD4 1205 aa8.24□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 HES2Q9Y543 173 aa8.24□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 MYH6P13533 1939 aa8.24□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa8.24□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa8.24□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa8.23□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 CHMP2AO43633 222 aa8.23□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 ECI2O75521 394 aa8.23□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 PSMD10O75832 226 aa8.23□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP8.23□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 ITGA4P13612 1032 aa8.23□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 CDC27P30260 824 aa8.23□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 SCNN1GP51170 649 aa8.23□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 NPEPPSP55786 919 aa8.23□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 SETQ01105 290 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 SATB1Q01826 763 aa8.23□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 ACAP1Q15027 740 aa8.23□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 RTP2Q5QGT7 225 aa8.23□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 FUT10Q6P4F1 479 aa8.23□□□□□ -1.09
CLVS1-211ENST00000524095 PRR23BQ6ZRT6 265 aa8.23□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.9 ms