RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	RBP3	P10745	1247 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	TGM1	P22735	817 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	CD40	P25942	277 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	HAL	P42357	657 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	SCAND1	P57086	179 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	ODF1	Q14990	250 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	LONRF1	Q17RB8	773 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	SRL	Q86TD4	932 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	CMIP	Q8IY22	773 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	OR14A2	Q96R54	314 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	ORAI2	Q96SN7	254 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	LUZP4	Q9P127	313 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	SWAP70	Q9UH65	585 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	DMTF1	Q9Y222	760 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	NR2E1	Q9Y466	385 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	ASB1	Q9Y576	335 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	TRIM75P	A6NK02	468 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702		F5H423	210 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	AP1G1	O43747	822 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	KDM1A	O60341	852 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	OFD1	O75665	1012 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	ADH4	P08319	380 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	BDNF	P23560	247 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	GPR3	P46089	330 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	KRT85	P78386	507 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	TUBA3C	Q13748	450 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	GALE	Q14376	348 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	RNF151	Q2KHN1	245 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	ALF	Q53S48	1182 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	NME9	Q86XW9	330 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	RUNDC1	Q96C34	613 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	ZG16B	Q96DA0	208 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	GBP4	Q96PP9	640 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC26A4	O43511	780 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	C1S	P09871	688 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	RRAD	P55042	308 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	HHEX	Q03014	270 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	SKAP1	Q86WV1	359 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	TMTC2	Q8N394	836 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	TEX19	Q8NA77	164 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	IL17D	Q8TAD2	202 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	TEKT5	Q96M29	485 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	MYD88	Q99836	296 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	MSRA	Q9UJ68	235 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	KLHL33	A6NCF5	533 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	MAFG	O15525	162 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	PCDHGA12	O60330	932 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	PRL	P01236	227 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	MAK	P20794	623 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	ACRV1	P26436	265 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	MC4R	P32245	332 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	AK2	P54819	239 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	BIRC3	Q13489	604 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	MYBPC3	Q14896	1274 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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