RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522638.1

IGKV3D-34-201, Transcript of immunoglobulin kappa variable 3D-34 (pseudogene), humanhuman

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Gene IGKV3D-34, Length 302 nt, Biotype IG V pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3D-34-201ENST00000522638 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
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IGKV3D-34-201ENST00000522638 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa6.71□□□□□ -1.34
IGKV3D-34-201ENST00000522638 MDM1Q8TC05 714 aa6.71□□□□□ -1.34
IGKV3D-34-201ENST00000522638 ING5Q8WYH8 240 aa6.71□□□□□ -1.34
IGKV3D-34-201ENST00000522638 B3GALT6Q96L58 329 aa6.71□□□□□ -1.34
IGKV3D-34-201ENST00000522638 LRRCC1Q9C099 1032 aa6.71□□□□□ -1.34
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IGKV3D-34-201ENST00000522638 FAN1Q9Y2M0 1017 aa6.71□□□□□ -1.34
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IGKV3D-34-201ENST00000522638 FAM193AP78312 1265 aa6.7□□□□□ -1.34
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IGKV3D-34-201ENST00000522638 LRRC32Q14392 662 aa6.7□□□□□ -1.34
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IGKV3D-34-201ENST00000522638 GLYCTKQ8IVS8 523 aa6.7□□□□□ -1.34
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IGKV3D-34-201ENST00000522638 MIER1Q8N108 512 aa6.7□□□□□ -1.34
IGKV3D-34-201ENST00000522638 PI4K2BQ8TCG2 481 aa6.7□□□□□ -1.34
IGKV3D-34-201ENST00000522638 ESR2Q92731 530 aa6.7□□□□□ -1.34
IGKV3D-34-201ENST00000522638 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
IGKV3D-34-201ENST00000522638 BRD9Q9H8M2 597 aa6.7□□□□□ -1.34
IGKV3D-34-201ENST00000522638 CHST12Q9NRB3 414 aa6.7□□□□□ -1.34
IGKV3D-34-201ENST00000522638 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
IGKV3D-34-201ENST00000522638 FAM105AQ9NUU6 356 aa6.7□□□□□ -1.34
IGKV3D-34-201ENST00000522638 GDE1Q9NZC3 331 aa6.7□□□□□ -1.34
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IGKV3D-34-201ENST00000522638 A0A087WV48 116 aa6.69□□□□□ -1.34
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IGKV3D-34-201ENST00000522638 CEBPBP17676 345 aa6.69□□□□□ -1.34
IGKV3D-34-201ENST00000522638 CREB5Q02930 508 aa6.69□□□□□ -1.34
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IGKV3D-34-201ENST00000522638 IRF7Q92985 503 aa6.69□□□□□ -1.34
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IGKV3D-34-201ENST00000522638 MSANTD3Q96H12 275 aa6.69□□□□□ -1.34
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IGKV3D-34-201ENST00000522638 CLMPQ9H6B4 373 aa6.69□□□□□ -1.34
IGKV3D-34-201ENST00000522638 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
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IGKV3D-34-201ENST00000522638 FLNCQ14315 2725 aa6.69□□□□□ -1.34
IGKV3D-34-201ENST00000522638 DENND4CQ5VZ89 1909 aa6.68□□□□□ -1.34
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IGKV3D-34-201ENST00000522638 XYLBO75191 536 aa6.68□□□□□ -1.34
IGKV3D-34-201ENST00000522638 POMCP01189 267 aa6.68□□□□□ -1.34
IGKV3D-34-201ENST00000522638 SKIP12755 728 aa6.68□□□□□ -1.34
IGKV3D-34-201ENST00000522638 GDI1P31150 447 aa6.68□□□□□ -1.34
IGKV3D-34-201ENST00000522638 SOX9P48436 509 aa6.68□□□□□ -1.34
IGKV3D-34-201ENST00000522638 NT5C2P49902 561 aa6.68□□□□□ -1.34
IGKV3D-34-201ENST00000522638 RAB27AP51159 221 aa6.68□□□□□ -1.34
IGKV3D-34-201ENST00000522638 SEMA3BQ13214 749 aa6.68□□□□□ -1.34
IGKV3D-34-201ENST00000522638 GRM4Q14833 912 aa6.68□□□□□ -1.34
IGKV3D-34-201ENST00000522638 SEC23AQ15436 765 aa6.68□□□□□ -1.34
IGKV3D-34-201ENST00000522638 UAP1L1Q3KQV9 507 aa6.68□□□□□ -1.34
IGKV3D-34-201ENST00000522638 CCDC178Q5BJE1 867 aa6.68□□□□□ -1.34
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