RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516226.1

RNU6-397P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 397, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-397P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-397P-201ENST00000516226 FDXRP22570 491 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 CTGFP29279 349 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 PHC1P78364 1004 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 CFAP100Q494V2 611 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 SPDYE7PQ495Y7 208 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 CREB3L3Q68CJ9 461 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 GAB3Q8WWW8 586 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 LRFN3Q9BTN0 628 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 PRDM13Q9H4Q3 707 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 RSAD1Q9HA92 442 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 SPON1Q9HCB6 807 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP3.32□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 RNF181Q9P0P0 153 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 TBKBP1A7MCY6 615 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 LEFTY2O00292 366 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 PJA2O43164 708 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 CDKL5O76039 1030 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 RAPGEF3O95398 923 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 CFIP05156 583 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 JMJD7P0C870 316 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 CRHR1P34998 444 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 FOXI1Q12951 378 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 NFE2L2Q16236 605 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 BMT2Q1RMZ1 405 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 BTNL9Q6UXG8 535 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 ANKS1AQ92625 1134 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 TFAP2CQ92754 450 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 IFT57Q9NWB7 429 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 KCNG1Q9UIX4 513 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 F2P00734 622 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 CFBP00751 764 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 CLEC2LP0C7M8 214 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 LSP1P33241 339 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 MPLP40238 635 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 FLT3LGP49771 235 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 MGAT5Q09328 741 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZNF460Q14592 562 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 FAM43AQ8N2R8 423 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZNF610Q8N9Z0 462 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 ADAM2Q99965 735 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 SEMA4GQ9NTN9 838 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 POGKQ9P215 609 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 MSRAQ9UJ68 235 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 NOX1Q9Y5S8 564 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 PHF2O75151 1096 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 SPDEFO95238 335 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 ITGAMP11215 1152 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 CACNA2D1P54289 1103 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 FOXF2Q12947 444 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 MAPK7Q13164 816 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 TP53BP2Q13625 1128 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 UBE3CQ15386 1083 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 AGAP9Q5VTM2 703 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 BHLHA9Q7RTU4 235 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 SYT12Q8IV01 421 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 RHOT2Q8IXI1 618 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 DRC7Q8IY82 874 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 OR14C36Q8NHC7 312 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZNF480Q8WV37 535 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 SNX33Q8WV41 574 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 ASB10Q8WXI3 467 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 CLUHP3Q96NS8 147 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 HEPHQ9BQS7 1158 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 SLC17A6Q9P2U8 582 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 USP18Q9UMW8 372 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 DMTF1Q9Y222 760 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 UNC119BA6NIH7 251 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 E9PSI1 815 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 ORC4O43929 436 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 PRAMEF4O60810 478 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 IGLV2-14P01704 120 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 RARRES1P49788 294 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 DSG1Q02413 1049 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 PPARAQ07869 468 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 RESTQ13127 1097 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 FRMD7Q6ZUT3 714 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 PTF1AQ7RTS3 328 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 XYLT1Q86Y38 959 aa3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.7 ms