RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515746.5

ATXN3-212, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5

Gene ATXN3, Length 619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-212	ENST00000515746		Q4G0T1	1027 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	MFSD5	Q6N075	450 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	GJB7	Q6PEY0	223 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	SMIM5	Q71RC9	77 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	VPS36	Q86VN1	386 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	HOOK3	Q86VS8	718 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	JAML	Q86YT9	394 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	PRELID2	Q8N945	189 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	GPATCH11	Q8N954	259 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	NEK9	Q8TD19	979 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	GLG1	Q92896	1179 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	CNKSR1	Q969H4	720 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	SPAG5	Q96R06	1193 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	FMO2	Q99518	471 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	MTFR1L	Q9H019	292 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	RAB17	Q9H0T7	212 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	DPH5	Q9H2P9	285 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	CENPH	Q9H3R5	247 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	CD209	Q9NNX6	404 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	AMFR	Q9UKV5	643 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	VAV3	Q9UKW4	847 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	PNMA2	Q9UL42	364 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	COG5	Q9UP83	839 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	STRC	Q7RTU9	1775 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	CFAP73	A6NFT4	308 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC169	A6NNP5	214 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	MEN1	O00255	615 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	OPLAH	O14841	1288 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	PHF2	O75151	1096 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	ATP6V1G2	O95670	118 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	EYA4	O95677	639 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	GGPS1	O95749	300 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	TTLL1	O95922	423 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	MME	P08473	750 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	RSPH10B	P0C881	870 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	CHN1	P15882	459 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	HSPA6	P17066	643 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	CHRNA3	P32297	505 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC8A1	P32418	973 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	CIITA	P33076	1130 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	EPS15	P42566	896 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	PEX5	P50542	639 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	CDR1	P51861	262 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	PMS2	P54278	862 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	CLN3	Q13286	438 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	AP3B2	Q13367	1082 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	CNGA2	Q16280	664 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	CYP1B1	Q16678	543 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	PTPRO	Q16827	1216 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	ODF2	Q5BJF6	829 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	DENND2C	Q68D51	928 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	MRPL14	Q6P1L8	145 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	TTC27	Q6P3X3	843 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	CROCCP2	Q86T23	111 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	DAAM2	Q86T65	1068 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		5.36	□□□□□ -1.55

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