RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512194.1

HERC3-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-210ENST00000512194 CPLX1O14810 134 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 PRDM1O75626 825 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 CDKL5O76039 1030 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 SYPP08247 313 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 RCAN1P53805 252 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 FKBP1BP68106 108 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 GABREP78334 506 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 PRKCQQ04759 706 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 TRIM61Q5EBN2 209 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 RCSD1Q6JBY9 416 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 CYB5R4Q7L1T6 521 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 CHST3Q7LGC8 479 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 SGMS1Q86VZ5 419 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 DGKHQ86XP1 1220 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 MISP3Q96FF7 219 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 DYNLL2Q96FJ2 89 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 C1orf159Q96HA4 380 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 HRASLS5Q96KN8 279 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 TCEANC2Q96MN5 208 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 LRRC2Q9BYS8 371 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 KAT14Q9H8E8 782 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 SPC25Q9HBM1 224 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 VAV3Q9UKW4 847 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 FZD1Q9UP38 647 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 TRIM17Q9Y577 477 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-210ENST00000512194 SSC5DA1L4H1 1573 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 TNKSO95271 1327 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 GOLGA8BA8MQT2 603 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 WASH4PA8MWX3 477 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 STXBP3O00186 592 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 ZBTB43O43298 467 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 EFCAB14O75071 495 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 KIF5BP33176 963 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 NF2P35240 595 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 ECI1P42126 302 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 GNAQP50148 359 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 GABPAQ06546 454 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 CYP4F3Q08477 520 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP8.39□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 FAM47AQ5JRC9 791 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 EEF1DP3Q658K8 133 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 KREMEN2Q8NCW0 462 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 AGXT2Q9BYV1 514 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 DEFB129Q9H1M3 183 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 INCENPQ9NQS7 918 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 SMC3Q9UQE7 1217 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 GOLGA8AA7E2F4 631 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 PFKFB2O60825 505 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 DNAJC6O75061 913 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
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HERC3-210ENST00000512194 SEPHS1P49903 392 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP8.38□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 EVCP57679 992 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 ANTXR2P58335 489 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
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HERC3-210ENST00000512194 CUL4AQ13619 759 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 TESK1Q15569 626 aa8.38□□□□□ -1.07
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HERC3-210ENST00000512194 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 TMEM179Q6ZVK1 233 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 ZFPM1Q8IX07 1006 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 FAM184AQ8NB25 1140 aa8.38□□□□□ -1.07
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HERC3-210ENST00000512194 FOXP3Q9BZS1 431 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 BRINP2Q9C0B6 783 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 SH2D4AQ9H788 454 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 LY9Q9HBG7 655 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 TPCN1Q9ULQ1 816 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 STX8Q9UNK0 236 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 H0YGN5 161 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 TTLL1O95922 423 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 ESR1P03372 595 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 THBDP07204 575 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 GSTM1P09488 218 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 SHMT1P34896 483 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 MASP1P48740 699 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 NUCB2P80303 420 aa8.37□□□□□ -1.07
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