RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
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SH3BP2-221ENST00000511747 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
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SH3BP2-221ENST00000511747 KRT39Q6A163 491 aa29.03■■■□□ 2.24
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