RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 IGSF21Q96ID5 467 aa20.61■□□□□ 0.89
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SH3BP2-218ENST00000511185 MARCH5Q9NX47 278 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP2-218ENST00000511185 DENND4AQ7Z401 1863 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2-218ENST00000511185 NASPP49321 788 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
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SH3BP2-218ENST00000511185 AAK1Q2M2I8 961 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2-218ENST00000511185 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
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SH3BP2-218ENST00000511185 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
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SH3BP2-218ENST00000511185 CCSER1Q9C0I3 900 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2-218ENST00000511185 KMT5AQ9NQR1 393 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2-218ENST00000511185 SNTG2Q9NY99 539 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2-218ENST00000511185 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
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SH3BP2-218ENST00000511185 A0A087X0B3 334 aa20.59■□□□□ 0.89
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SH3BP2-218ENST00000511185 PLS3P13797 630 aa20.59■□□□□ 0.89
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SH3BP2-218ENST00000511185 DSC1Q08554 894 aa20.59■□□□□ 0.89
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SH3BP2-218ENST00000511185 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
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SH3BP2-218ENST00000511185 F13A1P00488 732 aa20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2-218ENST00000511185 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC39A14Q15043 492 aa20.58■□□□□ 0.89
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SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa20.58■□□□□ 0.89
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SH3BP2-218ENST00000511185 TLE6Q9H808 572 aa20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2-218ENST00000511185 UBN1Q9NPG3 1134 aa20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2-218ENST00000511185 CLEC1BQ9P126 229 aa20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2-218ENST00000511185 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa20.58■□□□□ 0.88
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SH3BP2-218ENST00000511185 NRP1O14786 923 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 NDUFV1P49821 464 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 KRT17Q04695 432 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 ADAM15Q13444 863 aa20.57■□□□□ 0.88
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SH3BP2-218ENST00000511185 VPS52Q8N1B4 723 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 KCTD17Q8N5Z5 321 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 LINC00301Q8NCQ3 95 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
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SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM175Q9BSA9 504 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 CDT1Q9H211 546 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM134Q9H6X4 195 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 KCND2Q9NZV8 630 aa20.57■□□□□ 0.88
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SH3BP2-218ENST00000511185 GDAQ9Y2T3 454 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 C2orf71A6NGG8 1288 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 MAPTP10636 758 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 CA8P35219 290 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 OR1G1P47890 313 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 GRIK3Q13003 919 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 STK38Q15208 465 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF568Q3ZCX4 644 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 LLGL2Q6P1M3 1020 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 HACE1Q8IYU2 909 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 SPIRE2Q8WWL2 714 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 PPP2R3CQ969Q6 453 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 CHAMP1Q96JM3 812 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 MSLNLQ96KJ4 702 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 PAAF1Q9BRP4 392 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 ADPGKQ9BRR6 497 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 C17orf75Q9HAS0 396 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 PTPRHQ9HD43 1115 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 KANSL3Q9P2N6 904 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 TNFSF13BQ9Y275 285 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 HARSP12081 509 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 PROZP22891 400 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF131P52739 623 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 NCKAP1LP55160 1127 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 KCNC3Q14003 757 aa20.55■□□□□ 0.88
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SH3BP2-218ENST00000511185 GLRA4Q5JXX5 417 aa20.55■□□□□ 0.88
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