RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
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SH3BP2-210ENST00000505941 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa23.15■■□□□ 1.3
SH3BP2-210ENST00000505941 NRP1O14786 923 aa23.14■■□□□ 1.29
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SH3BP2-210ENST00000505941 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP23.14■■□□□ 1.29
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SH3BP2-210ENST00000505941 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa23.12■■□□□ 1.29
SH3BP2-210ENST00000505941 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
SH3BP2-210ENST00000505941 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa23.12■■□□□ 1.29
SH3BP2-210ENST00000505941 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa23.12■■□□□ 1.29
SH3BP2-210ENST00000505941 K7ENM7 598 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2-210ENST00000505941 TOM1L1O75674 476 aa23.11■■□□□ 1.29
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SH3BP2-210ENST00000505941 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP23.11■■□□□ 1.29
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SH3BP2-210ENST00000505941 NCKAP1LP55160 1127 aa23.11■■□□□ 1.29
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