RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499624.3

GABPB1-AS1-202, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GABPB1-AS1, Length 16,182 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FGD4Q96M96 766 aa4.8□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP4.8□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LRWD1Q9UFC0 647 aa4.8□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DOCK2Q92608 1830 aa4.8□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ATRNL1Q5VV63 1379 aa4.8□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GCNT3O95395 438 aa4.8□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 IFNA14P01570 189 aa4.8□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ADCY2Q08462 1091 aa4.8□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NR5A1Q13285 461 aa4.8□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FAM182AQ5T1J6 154 aa4.8□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 BHLHB9Q6PI77 547 aa4.8□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GPR88Q9GZN0 384 aa4.8□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 COPG2Q9UBF2 871 aa4.8□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RBM10P98175 930 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CYP4A11Q02928 519 aa4.8□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CRY1Q16526 586 aa4.8□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FKBP9P1Q75LS8 142 aa4.8□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 BLIDQ8IZY5 108 aa4.8□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 REPS1Q96D71 796 aa4.8□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FBXO44Q9H4M3 255 aa4.8□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PLA2G6O60733 806 aa4.8□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LIG1P18858 919 aa4.8□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TTC8Q8TAM2 541 aa4.8□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CEP95Q96GE4 821 aa4.8□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 VCPIP1Q96JH7 1222 aa4.8□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZWILCHQ9H900 591 aa4.8□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FAM107AO95990 144 aa4.8□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SERPINB10P48595 397 aa4.8□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PTPROQ16827 1216 aa4.8□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LZTR1Q8N653 840 aa4.8□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 COG1Q8WTW3 980 aa4.8□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MTFR1LQ9H019 292 aa4.8□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 EFCC1Q9HA90 598 aa4.8□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP4.8□□□□□ -1.644e-7■■■■■ 34.5
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SLCO1B7G3V0H7 640 aa4.8□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RGS4P49798 205 aa4.8□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SLC10A4Q96EP9 437 aa4.8□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ACCSQ96QU6 501 aa4.8□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FBRSQ9HAH7 460 aa4.8□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 STAP2Q9UGK3 403 aa4.8□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa4.8□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MAPK13O15264 365 aa4.79□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 S100GP29377 79 aa4.79□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CCDC134Q9H6E4 229 aa4.79□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ACAD9Q9H845 621 aa4.79□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GIMAP4Q9NUV9 329 aa4.79□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TAF1LQ8IZX4 1826 aa4.79□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa4.79□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RPS6KB1P23443 525 aa4.79□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DCKP27707 260 aa4.79□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ESRRGP62508 458 aa4.79□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SGMS1Q86VZ5 419 aa4.79□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CCDC127Q96BQ5 260 aa4.79□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CENPOQ9BU64 300 aa4.79□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ASB7Q9H672 318 aa4.79□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MTHFD1LQ6UB35 978 aa4.79□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP4.79□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 STK40Q8N2I9 435 aa4.79□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa4.79□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PSD3Q9NYI0 1048 aa4.79□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 WWP2O00308 870 aa4.79□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 C21orf2O43822 256 aa4.79□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 XYLBO75191 536 aa4.79□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SASH1O94885 1247 aa4.79□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SDSP20132 328 aa4.79□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NOSTRINQ8IVI9 506 aa4.79□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TEX9Q8N6V9 391 aa4.79□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa4.79□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CRYL1Q9Y2S2 319 aa4.79□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SCN8AQ9UQD0 1980 aa4.79□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZBED1O96006 694 aa4.79□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NUDT1P36639 197 aa4.79□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PRCPP42785 496 aa4.79□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PKN1Q16512 942 aa4.79□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MYO1HQ8N1T3 1032 aa4.79□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SELENONQ9NZV5 590 aa4.79□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 BTBD7Q9P203 1132 aa4.79□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GHRLQ9UBU3 117 aa4.79□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 S100A7P31151 101 aa4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms