RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498428.5

ROBO1-211, Transcript of roundabout guidance receptor 1, humanhuman

TSL 2

Gene ROBO1, Length 3,566 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO1-211ENST00000498428 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 VEGFBP49765 207 aa7.76□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP7.76□□□□□ -1.179e-7■■■■■ 44.5
ROBO1-211ENST00000498428 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 EMC10Q5UCC4 262 aa7.76□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 SV2BQ7L1I2 683 aa7.76□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 GPR142Q7Z601 462 aa7.76□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 DCLK2Q8N568 766 aa7.76□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 NDNQ99608 321 aa7.76□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa7.76□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 RETREG1Q9H6L5 497 aa7.76□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 EXOC1Q9NV70 894 aa7.76□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 ZNF536O15090 1300 aa7.76□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 TMEM221A6NGB7 291 aa7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 MSH4O15457 936 aa7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 GFPT2O94808 682 aa7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 ALADP13716 330 aa7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 DESP17661 470 aa7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 PTPREP23469 700 aa7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 MAP3K10Q02779 954 aa7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 GPBP1Q86WP2 473 aa7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 TRIM50Q86XT4 487 aa7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 SLFN12Q8IYM2 578 aa7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 TEX9Q8N6V9 391 aa7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 CD99L2Q8TCZ2 262 aa7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 SPATA33Q96N06 139 aa7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 BRD8Q9H0E9 1235 aa7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 KCNMB3Q9NPA1 279 aa7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 PDGFCQ9NRA1 345 aa7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 ATXN10Q9UBB4 475 aa7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 COMMD10Q9Y6G5 202 aa7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 TEX33O43247 280 aa7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 FAM13AO94988 1023 aa7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 GHRP10912 638 aa7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 CMA1P23946 247 aa7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 COPB2P35606 906 aa7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 PGM5Q15124 567 aa7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 NPY5RQ15761 445 aa7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 MAP7D1Q3KQU3 841 aa7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 FOXB2Q5VYV0 432 aa7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 ALKBH2Q6NS38 261 aa7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 RPS6KC1Q96S38 1066 aa7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 CORO1BQ9BR76 489 aa7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 DISC1Q9NRI5 854 aa7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 GUCA1BQ9UMX6 200 aa7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 NOD1Q9Y239 953 aa7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 SAR1BQ9Y6B6 198 aa7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 ESYT2A0FGR8 921 aa7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 ZBTB39O15060 712 aa7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 ATP9AO75110 1047 aa7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 E2F6O75461 281 aa7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 VIMP08670 466 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 RFC5P40937 340 aa7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 ADCYAP1R1P41586 468 aa7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 KCNJ2P63252 427 aa7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 LRRC41Q15345 812 aa7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 TKFCQ3LXA3 575 aa7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 FAM102BQ5T8I3 360 aa7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 PLA2G4FQ68DD2 849 aa7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 RIOX2Q8IUF8 465 aa7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 CLEC4DQ8WXI8 215 aa7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 CLIP3Q96DZ5 547 aa7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 MS4A4AQ96JQ5 239 aa7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 MXRA8Q9BRK3 442 aa7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 LRRC1Q9BTT6 524 aa7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 BCAS3Q9H6U6 928 aa7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 KCNH4Q9UQ05 1017 aa7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 TLL2Q9Y6L7 1015 aa7.75□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 SSC5DA1L4H1 1573 aa7.74□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 A0A1W2PQ27 194 aa7.74□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 A0A1W2PQ64 194 aa7.74□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 A0A1W2PQD8 194 aa7.74□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 TRAPPC3O43617 180 aa7.74□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 PPP6R2O75170 966 aa7.74□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 MYL3P08590 195 aa7.74□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 ITGB5P18084 799 aa7.74□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 CCND1P24385 295 aa7.74□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 TMOD1P28289 359 aa7.74□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 FLT3LGP49771 235 aa7.74□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 FCGRTP55899 365 aa7.74□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 AMPD3Q01432 767 aa7.74□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 SP3Q02447 781 aa7.74□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 CUL4BQ13620 913 aa7.74□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 POSTNQ15063 836 aa7.74□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 CCL14Q16627 93 aa7.74□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 CCDC38Q502W7 563 aa7.74□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 PPP4R3AQ6IN85 833 aa7.74□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 TMEM154Q6P9G4 183 aa7.74□□□□□ -1.17
ROBO1-211ENST00000498428 CAGE1Q8TC20 777 aa7.74□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.5 ms