RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496565.5

LPIN3-204, Transcript of lipin 3, human

TSL 3

Gene LPIN3, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LPIN3-204	ENST00000496565	CTGF	P29279	349 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	PRKCI	P41743	596 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	MXI1	P50539	228 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	VPS36	Q86VN1	386 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	C7orf31	Q8N865	590 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	ASB7	Q9H672	318 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	GABRQ	Q9UN88	632 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	AKT3	Q9Y243	479 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565		A0A1B0GUA9	196 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	ADAMTS4	O75173	837 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	LCA5L	O95447	670 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	SERPING1	P05155	500 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	ADRB2	P07550	413 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	MYL3	P08590	195 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	ZNF286B	P0CG31	522 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	STAT1	P42224	750 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	MYL7	Q01449	175 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	LRMP	Q12912	555 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	PDXDC1	Q6P996	788 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	WDR49	Q8IV35	697 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	BAP1	Q92560	729 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	CCDC42	Q96M95	316 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	SPAG5	Q96R06	1193 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	TCHP	Q9BT92	498 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	GAN	Q9H2C0	597 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	GCNT4	Q9P109	453 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	DERA	Q9Y315	318 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565		M0QZ92	97 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	ADCY6	O43306	1168 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	B4GALT4	O60513	344 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	NOL4	O94818	638 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	ERLIN2	O94905	339 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	CYP2C9	P11712	490 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	CLCN3	P51790	818 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	MFAP3	P55082	362 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	SOX10	P56693	466 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	GCNT1	Q02742	428 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	ZACN	Q401N2	412 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	EPC2	Q52LR7	807 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	KSR1	Q8IVT5	923 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	TTC39C	Q8N584	583 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	USP38	Q8NB14	1042 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	TRPV1	Q8NER1	839 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	LMO3	Q8TAP4	145 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	NLRP4	Q96MN2	994 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	CGRRF1	Q99675	332 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LPIN3-204	ENST00000496565	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		10.18	□□□□□ -0.78

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