RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491607.5

SMIM4-205, Transcript of small integral membrane protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SMIM4, Length 314 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM4-205ENST00000491607 LILRB3O75022 631 aa20.34■□□□□ 0.85
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SMIM4-205ENST00000491607 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SMIM4-205ENST00000491607 KREMEN2Q8NCW0 462 aa20.34■□□□□ 0.85
SMIM4-205ENST00000491607 PRIMPOLQ96LW4 560 aa20.34■□□□□ 0.85
SMIM4-205ENST00000491607 RPS6KC1Q96S38 1066 aa20.34■□□□□ 0.85
SMIM4-205ENST00000491607 KIF2CQ99661 725 aa20.34■□□□□ 0.85
SMIM4-205ENST00000491607 COLEC11Q9BWP8 271 aa20.34■□□□□ 0.85
SMIM4-205ENST00000491607 C2orf40Q9H1Z8 148 aa20.34■□□□□ 0.85
SMIM4-205ENST00000491607 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
SMIM4-205ENST00000491607 TRAPPC10P48553 1259 aa20.33■□□□□ 0.85
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SMIM4-205ENST00000491607 MTMR3Q13615 1198 aa20.33■□□□□ 0.85
SMIM4-205ENST00000491607 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa20.33■□□□□ 0.85
SMIM4-205ENST00000491607 FBXL6Q8N531 539 aa20.33■□□□□ 0.85
SMIM4-205ENST00000491607 DEPTORQ8TB45 409 aa20.33■□□□□ 0.85
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SMIM4-205ENST00000491607 ASIC4Q96FT7 647 aa20.33■□□□□ 0.85
SMIM4-205ENST00000491607 LRWD1Q9UFC0 647 aa20.33■□□□□ 0.85
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SMIM4-205ENST00000491607 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
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SMIM4-205ENST00000491607 N4BP3O15049 544 aa20.31■□□□□ 0.84
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SMIM4-205ENST00000491607 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP20.31■□□□□ 0.84
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SMIM4-205ENST00000491607 BHMT2Q9H2M3 363 aa20.31■□□□□ 0.84
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SMIM4-205ENST00000491607 USP20Q9Y2K6 914 aa20.31■□□□□ 0.84
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SMIM4-205ENST00000491607 UBALD2Q8IYN6 164 aa20.3■□□□□ 0.84
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SMIM4-205ENST00000491607 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa20.3■□□□□ 0.84
SMIM4-205ENST00000491607 PLCD3Q8N3E9 789 aa20.3■□□□□ 0.84
SMIM4-205ENST00000491607 C4orf32Q8N8J7 132 aa20.3■□□□□ 0.84
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SMIM4-205ENST00000491607 RAB34Q9BZG1 259 aa20.3■□□□□ 0.84
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SMIM4-205ENST00000491607 CACNG4Q9UBN1 327 aa20.3■□□□□ 0.84
SMIM4-205ENST00000491607 ADAM28Q9UKQ2 775 aa20.3■□□□□ 0.84
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SMIM4-205ENST00000491607 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SMIM4-205ENST00000491607 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
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SMIM4-205ENST00000491607 OTOP3Q7RTS5 596 aa20.28■□□□□ 0.84
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