RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490108.1

TSC2-215, Transcript of TSC complex subunit 2, humanhuman

TSL 4

Gene TSC2, Length 482 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2-215ENST00000490108 NHLH1Q02575 133 aa22.14■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 NBR1Q14596 966 aa22.14■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 PADI6Q6TGC4 694 aa22.14■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 NOSTRINQ8IVI9 506 aa22.14■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 FBXL6Q8N531 539 aa22.14■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa22.14■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 BSNDQ8WZ55 320 aa22.14■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 ASIC4Q96FT7 647 aa22.14■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 RPS6KC1Q96S38 1066 aa22.14■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 DENND4AQ7Z401 1863 aa22.13■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 A0A1B0GUA9 196 aa22.13■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 RPA1P27694 616 aa22.13■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 HAUS3Q68CZ6 603 aa22.13■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa22.13■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 PRIMPOLQ96LW4 560 aa22.13■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 C2orf40Q9H1Z8 148 aa22.13■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa22.13■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa22.12■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 PLXNA3P51805 1871 aa22.12■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 KMT2EQ8IZD2 1858 aa22.12■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 ASGR2P07307 311 aa22.12■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 ADH1AP07327 375 aa22.12■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 GRIK3Q13003 919 aa22.12■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 MTMR3Q13615 1198 aa22.12■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 GPR149Q86SP6 731 aa22.12■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 DEPTORQ8TB45 409 aa22.12■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 B3GALT6Q96L58 329 aa22.12■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 COLEC11Q9BWP8 271 aa22.12■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 MAN1C1Q9NR34 630 aa22.12■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 SORCS3Q9UPU3 1222 aa22.12■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 TTLL13PA6NNM8 815 aa22.11■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 TEX28O15482 410 aa22.11■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 PRKCBP05771 671 aa22.11■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 MYBP10242 640 aa22.11■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 CYP11B2P19099 503 aa22.11■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 TRAPPC10P48553 1259 aa22.11■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 IER5LQ5T953 404 aa22.11■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 CCDC149Q6ZUS6 474 aa22.11■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 GSTCDQ8NEC7 633 aa22.11■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 PRSS33Q8NF86 280 aa22.11■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 RABGGTAQ92696 567 aa22.11■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 KIF2CQ99661 725 aa22.11■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 SMOC2Q9H3U7 446 aa22.11■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 FZD8Q9H461 694 aa22.11■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 PDZD7Q9H5P4 517 aa22.11■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa22.11■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 C2orf16Q68DN1 1984 aa22.1■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 PIEZO1Q92508 2521 aa22.1■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 N4BP3O15049 544 aa22.1■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 BRD1O95696 1058 aa22.1■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 GLUD1P00367 558 aa22.1■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 VCPP55072 806 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 MAPK6Q16659 721 aa22.1■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 FAM187BQ17R55 369 aa22.1■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 C8orf34Q49A92 452 aa22.1■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 FUT10Q6P4F1 479 aa22.1■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa22.1■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 KIFC3Q9BVG8 833 aa22.1■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 CACNG4Q9UBN1 327 aa22.1■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 LIMD1Q9UGP4 676 aa22.1■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 USP20Q9Y2K6 914 aa22.1■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 EFEMP2O95967 443 aa22.09■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 NAMPTP43490 491 aa22.09■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 DSG1Q02413 1049 aa22.09■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 ECM1Q16610 540 aa22.09■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 KIAA0319Q5VV43 1072 aa22.09■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 UBALD2Q8IYN6 164 aa22.09■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 GPR62Q9BZJ7 368 aa22.09■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 BHMT2Q9H2M3 363 aa22.09■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 POLD4Q9HCU8 107 aa22.09■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 SNTG2Q9NY99 539 aa22.09■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 LRWD1Q9UFC0 647 aa22.09■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 ADAM28Q9UKQ2 775 aa22.09■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 USTQ9Y2C2 406 aa22.09■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 MYO10Q9HD67 2058 aa22.08■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 CASTOR2A6NHX0 329 aa22.08■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 PPP2R5AQ15172 486 aa22.08■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa22.08■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 PLCD3Q8N3E9 789 aa22.08■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 C4orf32Q8N8J7 132 aa22.08■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 SNX29Q8TEQ0 813 aa22.08■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 HASPINQ8TF76 798 aa22.08■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 IFT74Q96LB3 600 aa22.08■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 ADPGKQ9BRR6 497 aa22.08■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 CCDC113Q9H0I3 377 aa22.08■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 RXFP1Q9HBX9 757 aa22.08■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 KIAA1024Q9UPX6 916 aa22.08■■□□□ 1.13
TSC2-215ENST00000490108 TADA2AO75478 443 aa22.07■■□□□ 1.12
TSC2-215ENST00000490108 RECQL4O94761 1208 aa22.07■■□□□ 1.12
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