RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF536O15090 1300 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 CCDC154A6NI56 674 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 PRRG2O14669 202 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 ADCY6O43306 1168 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC26A4O43511 780 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 MARCH6O60337 910 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 CDC14BO60729 498 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 PHF2O75151 1096 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 RFPL1O75677 317 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 JUNP05412 331 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 INHBBP09529 407 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 CR2P20023 1033 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 EDNRBP24530 442 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 CASRP41180 1078 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 WNT3AP56704 352 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 DUSP2Q05923 314 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 MGAT2Q10469 447 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 SURF1Q15526 300 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 MST1LQ2TV78 715 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 GAGE13Q4V321 117 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 C19orf54Q5BKX5 351 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 Q6ZVL8 140 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 TTLL10Q6ZVT0 673 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 FRMD5Q7Z6J6 570 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 CATIPQ7Z7H3 387 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 GPR135Q8IZ08 494 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 SHCBP1Q8NEM2 672 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF480Q8WV37 535 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 GNRHR2Q96P88 292 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 CAMKK2Q96RR4 588 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 SEC61A2Q9H9S3 476 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 CHPF2Q9P2E5 772 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 IPPQ9Y573 584 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 GRIN2BQ13224 1484 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 ABCC8Q09428 1581 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 GRIN2AQ12879 1464 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 A0A1W2PRX2 142 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 UBE2QL1A1L167 161 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 B8ZZF3 427 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 ITGA10O75578 1167 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 PLATP00750 562 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 ECHS1P30084 290 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 WASP42768 502 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC6A9P48067 706 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 DUSP8Q13202 625 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 IL10RAQ13651 578 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 UBXN11Q5T124 520 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 SLFN13Q68D06 897 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM180AQ6UWF9 173 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 TAX1BP1Q86VP1 789 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 CMTM4Q8IZR5 234 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 REPS2Q8NFH8 660 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 KAT5Q92993 513 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 RAB24Q969Q5 203 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 LRGUKQ96M69 825 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 PLA2G12BQ9BX93 195 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 LDAHQ9H6V9 325 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 IL23AQ9NPF7 189 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 GPRC5DQ9NZD1 345 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 TRPS1Q9UHF7 1281 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 RCAN3Q9UKA8 241 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 SIK3Q9Y2K2 1263 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 ABCC10Q5T3U5 1492 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 KDM6BO15054 1643 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM171A2A8MVW0 826 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 NRP1O14786 923 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 STC2O76061 302 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 POU2F2P09086 479 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 GYPEP15421 78 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 VCAM1P19320 739 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 HOXA5P20719 270 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 SREBF1P36956 1147 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 PER3P56645 1201 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 MLC1Q15049 377 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM102BQ5T8I3 360 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 MIGA2Q7L4E1 593 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 LIMS2Q7Z4I7 341 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 RHOT1Q8IXI2 618 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 MYO1HQ8N1T3 1032 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 PQLC1Q8N2U9 271 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 OR7D4Q8NG98 312 aa4.26□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms