RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 CAND2O75155 1236 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 PER3P56645 1201 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 RAC3P60763 192 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 DUSP2Q05923 314 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 IL10RAQ13651 578 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 TTC7BQ86TV6 843 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 DGKHQ86XP1 1220 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 CERS3Q8IU89 383 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 RHOT1Q8IXI2 618 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 CFHR4Q92496 578 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 RABGGTAQ92696 567 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 PSMD1Q99460 953 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 XYLT2Q9H1B5 865 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 MSL2Q9HCI7 577 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 C1orf112Q9NSG2 853 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 TRPS1Q9UHF7 1281 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 ITGA10O75578 1167 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 INHBBP09529 407 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 SREBF1P36956 1147 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 SLC6A9P48067 706 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP6.37□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 ADAM8P78325 824 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 GBX1Q14549 363 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 SURF1Q15526 300 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 TTLL10Q6ZVT0 673 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 FRMD5Q7Z6J6 570 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 PQLC1Q8N2U9 271 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 SYT8Q8NBV8 401 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 FEZF2Q8TBJ5 459 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 TDP1Q9NUW8 608 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 SIK3Q9Y2K2 1263 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 H3BML4 177 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 SLC26A4O43511 780 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 PPP2CBP62714 309 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 PPP2CAP67775 309 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 CDC42EP1Q00587 391 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 ACAP1Q15027 740 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 DENND1CQ8IV53 801 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 DRC7Q8IY82 874 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 CMTM4Q8IZR5 234 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 CAMKK1Q8N5S9 505 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 KAT5Q92993 513 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 GPHA2Q96T91 129 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 SEC61A2Q9H9S3 476 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 KMT5AQ9NQR1 393 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 LANCL2Q9NS86 450 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 GABBR1Q9UBS5 961 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 MATN2O00339 956 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 SLC16A6O15403 523 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 KRT18P05783 430 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 HOXA5P20719 270 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 IL12RB1P42701 662 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 DSC2Q02487 901 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 RSPH3Q86UC2 560 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 ZBTB34Q8NCN2 500 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 OR5M3Q8NGP4 307 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 PDCD2LQ9BRP1 358 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 IL23AQ9NPF7 189 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 NCDNQ9UBB6 729 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 OAZ3Q9UMX2 235 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 ADCY6O43306 1168 aa6.34□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 CASRP41180 1078 aa6.34□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 EPHB4P54760 987 aa6.34□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 NPEPPSP55786 919 aa6.34□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 RIN1Q13671 783 aa6.34□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP6.34□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 GRM3Q14832 879 aa6.34□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa6.34□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 SLC4A10Q6U841 1118 aa6.34□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa6.34□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 CCDC146Q8IYE0 955 aa6.34□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 SHCBP1Q8NEM2 672 aa6.34□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 CCHCR1Q8TD31 782 aa6.34□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa6.34□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 RGMAQ96B86 450 aa6.34□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 CLPTM1LQ96KA5 538 aa6.34□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 LMF1Q96S06 567 aa6.34□□□□□ -1.39
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