RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 PPP2R5AQ15172 486 aa22.3■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 MAPK6Q16659 721 aa22.3■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 AMHR2Q16671 573 aa22.3■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 POTEGQ6S5H5 508 aa22.3■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 PADI6Q6TGC4 694 aa22.3■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 NOSTRINQ8IVI9 506 aa22.3■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 UBALD2Q8IYN6 164 aa22.3■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 KREMEN2Q8NCW0 462 aa22.3■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa22.3■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 DEPTORQ8TB45 409 aa22.3■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 ADPGKQ9BRR6 497 aa22.3■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 RAB34Q9BZG1 259 aa22.3■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 N4BP3O15049 544 aa22.29■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 MUTP22033 750 aa22.29■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 CLCN4P51793 760 aa22.29■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 GRIK3Q13003 919 aa22.29■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 KANK3Q6NY19 840 aa22.29■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 IFT74Q96LB3 600 aa22.29■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 MARCH5Q9NX47 278 aa22.29■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 MIOSQ9NXC5 875 aa22.29■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 KLK14Q9P0G3 267 aa22.29■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 USTQ9Y2C2 406 aa22.29■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 STK24Q9Y6E0 443 aa22.29■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa22.28■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 TECTAO75443 2155 aa22.28■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 LIG1P18858 919 aa22.28■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 DSC1Q08554 894 aa22.28■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa22.28■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 CCDC149Q6ZUS6 474 aa22.28■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 GPR149Q86SP6 731 aa22.28■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa22.28■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 LRWD1Q9UFC0 647 aa22.28■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 GLUD1P00367 558 aa22.27■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 CYP11B2P19099 503 aa22.27■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 NHLH1Q02575 133 aa22.27■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 OTOP3Q7RTS5 596 aa22.27■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 MAN1C1Q9NR34 630 aa22.27■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 LIMD1Q9UGP4 676 aa22.27■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 KIF3AQ9Y496 699 aa22.27■■□□□ 1.16
ACTB-212ENST00000484841 LILRB3O75022 631 aa22.26■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 TADA2AO75478 443 aa22.26■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 PRKCBP05771 671 aa22.26■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 NAMPTP43490 491 aa22.26■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 FAM187BQ17R55 369 aa22.26■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 USP41Q3LFD5 358 aa22.26■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa22.26■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 TAS1R1Q7RTX1 841 aa22.26■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 ASIC4Q96FT7 647 aa22.26■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 FZD8Q9H461 694 aa22.26■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP22.26■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 TEX28O15482 410 aa22.25■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP22.25■■□□□ 1.152e-53■■□□□ 12.2
ACTB-212ENST00000484841 PTPN5P54829 565 aa22.25■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 DSG1Q02413 1049 aa22.25■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 CREMQ03060 361 aa22.25■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 FUT10Q6P4F1 479 aa22.25■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 ADAM28Q9UKQ2 775 aa22.25■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 PLXNA3P51805 1871 aa22.25■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 MYO10Q9HD67 2058 aa22.25■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 DENND4AQ7Z401 1863 aa22.24■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa22.24■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 EFNA5P52803 228 aa22.24■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 TUSC3Q13454 348 aa22.24■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 KIAA0319Q5VV43 1072 aa22.24■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 STAMQ92783 540 aa22.24■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 KIFAP3Q92845 792 aa22.24■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 BHMT2Q9H2M3 363 aa22.24■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 PIDD1Q9HB75 910 aa22.24■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 KIAA1024Q9UPX6 916 aa22.24■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 C2orf16Q68DN1 1984 aa22.23■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 ACKR2O00590 384 aa22.23■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 ST18O60284 1047 aa22.23■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 THP07101 528 aa22.23■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 PDIA5Q14554 519 aa22.23■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 KRT79Q5XKE5 535 aa22.23■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 CYP26C1Q6V0L0 522 aa22.23■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 PALB2Q86YC2 1186 aa22.23■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 GSTCDQ8NEC7 633 aa22.23■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 SNX29Q8TEQ0 813 aa22.23■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 MFSD1Q9H3U5 465 aa22.23■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 PDZD7Q9H5P4 517 aa22.23■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 RXFP1Q9HBX9 757 aa22.23■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 SNTG2Q9NY99 539 aa22.23■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 KMT2EQ8IZD2 1858 aa22.23■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.152e-7■■□□□ 13.7
ACTB-212ENST00000484841 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 LAD1O00515 517 aa22.22■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 BRD1O95696 1058 aa22.22■■□□□ 1.15
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