RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 PARP2Q9UGN5 583 aa23.03■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 LZTS1Q9Y250 596 aa23.03■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 MYMKA6NI61 221 aa23.02■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 CSPG5O95196 566 aa23.02■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 SCNN1GP51170 649 aa23.02■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 E2F4Q16254 413 aa23.02■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa23.02■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 DYMQ7RTS9 669 aa23.02■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 HAUS6Q7Z4H7 955 aa23.02■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 DDX12PQ92771 950 aa23.02■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 ABLIM1O14639 778 aa23.01■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 TRAK2O60296 914 aa23.01■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 TBCAO75347 108 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 PROZP22891 400 aa23.01■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 ME1P48163 572 aa23.01■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 SLC11A1P49279 550 aa23.01■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 ERVFC1P60507 584 aa23.01■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 DNAJC19Q96DA6 116 aa23.01■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 ZHX3Q9H4I2 956 aa23.01■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 KLK14Q9P0G3 267 aa23.01■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 THEGQ9P2T0 379 aa23.01■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa23.01■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa23.01■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 H0YCG3 227 aa23■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 FSCN2O14926 492 aa23■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 KRT17Q04695 432 aa23■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 DSC1Q08554 894 aa23■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 STRN3Q13033 797 aa23■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 COLGALT2Q8IYK4 626 aa23■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 TMEM175Q9BSA9 504 aa23■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 CDT1Q9H211 546 aa23■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 TLR9Q9NR96 1032 aa23■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 COG5Q9UP83 839 aa23■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa23■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 MYH11P35749 1972 aa23■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 CARNS1A5YM72 827 aa22.99■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 ALDH2P05091 517 aa22.99■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 NMT1P30419 496 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 KRT85P78386 507 aa22.99■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 RESP18Q5W5W9 173 aa22.99■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 HLA-CQ95604 372 aa22.99■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 IGSF21Q96ID5 467 aa22.99■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 CXCL16Q9H2A7 254 aa22.99■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa22.98■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa22.98■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 K7ENM7 598 aa22.98■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 NRP1O14786 923 aa22.98■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 RECQL4O94761 1208 aa22.98■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 HYAL1Q12794 435 aa22.98■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 COL19A1Q14993 1142 aa22.98■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 ZNF568Q3ZCX4 644 aa22.98■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 MPZL3Q6UWV2 235 aa22.98■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 ZPBP2Q6X784 338 aa22.98■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa22.98■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 ZBTB33Q86T24 672 aa22.98■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 CEP120Q8N960 986 aa22.98■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa22.98■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 TMEM169Q96HH4 297 aa22.98■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 TBX20Q9UMR3 447 aa22.98■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 FAN1Q9Y2M0 1017 aa22.98■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 GDAQ9Y2T3 454 aa22.98■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa22.98■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 BRWD1Q9NSI6 2320 aa22.97■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 TOM1L1O75674 476 aa22.97■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 MCF2P10911 925 aa22.97■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 SCP2P22307 547 aa22.97■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 GTF2BQ00403 316 aa22.97■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 TFF2Q03403 129 aa22.97■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 GRIK3Q13003 919 aa22.97■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 SFR1Q86XK3 245 aa22.97■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 FAM178BQ8IXR5 827 aa22.97■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 IQUBQ8NA54 791 aa22.97■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 STAMQ92783 540 aa22.97■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 DHX58Q96C10 678 aa22.97■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 SPATA32Q96LK8 384 aa22.97■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 TCHPQ9BT92 498 aa22.97■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 CUEDC2Q9H467 287 aa22.97■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 KBTBD4Q9NVX7 518 aa22.97■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 PTGESO14684 152 aa22.96■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP22.96■■□□□ 1.272e-13■■□□□ 12.1
ACTB-211ENST00000480301 GRM5P41594 1212 aa22.96■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 ZNF720Q7Z2F6 126 aa22.96■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 RPS6KC1Q96S38 1066 aa22.96■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 TCF25Q9BQ70 676 aa22.96■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 VN1R3Q9BXE9 311 aa22.96■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 TNMDQ9H2S6 317 aa22.96■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa22.96■■□□□ 1.27
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