RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478954.1

STRADBP1-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene STRADBP1, Length 1,281 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBP1-201ENST00000478954 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa6.89□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 CPDO75976 1380 aa6.89□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 ABCC11Q96J66 1382 aa6.89□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa6.89□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 COL6A3P12111 3177 aa6.88□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 ITSN1Q15811 1721 aa6.88□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 ANKARQ7Z5J8 1434 aa6.88□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa6.88□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 NBNO60934 754 aa6.88□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 FUCA1P04066 466 aa6.88□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 GLI1P08151 1106 aa6.88□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 PDCP20941 246 aa6.88□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 MANFP55145 182 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 SOX10P56693 466 aa6.88□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 RTP1P59025 263 aa6.88□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 STK3Q13188 491 aa6.88□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 CCDC149Q6ZUS6 474 aa6.88□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 NLRX1Q86UT6 975 aa6.88□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 ZZZ3Q8IYH5 903 aa6.88□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 PPM1NQ8N819 430 aa6.88□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 MVB12AQ96EY5 273 aa6.88□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 MAP3K14Q99558 947 aa6.88□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.88□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 MTA3Q9BTC8 594 aa6.88□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 RSAD1Q9HA92 442 aa6.88□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC6A20Q9NP91 592 aa6.88□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 CASS4Q9NQ75 786 aa6.88□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 KCNH7Q9NS40 1196 aa6.88□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 LUZP4Q9P127 313 aa6.88□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa6.88□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 ATP23Q9Y6H3 246 aa6.88□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 TAF1LQ8IZX4 1826 aa6.87□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 LTBP1Q14766 1721 aa6.87□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM90A27PA6NNH2 459 aa6.87□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 DGKIO75912 1065 aa6.87□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 LPLP06858 475 aa6.87□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 SEMA5AQ13591 1074 aa6.87□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 EPHA7Q15375 998 aa6.87□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 UGT8Q16880 541 aa6.87□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 PITRM1Q5JRX3 1037 aa6.87□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa6.87□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa6.87□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 USP45Q70EL2 814 aa6.87□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 SPPL2CQ8IUH8 684 aa6.87□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 LILRA2Q8N149 483 aa6.87□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 PRR18Q8N4B5 295 aa6.87□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 ANKRD42Q8N9B4 389 aa6.87□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC17A8Q8NDX2 589 aa6.87□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 SSH1Q8WYL5 1049 aa6.87□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 COA7Q96BR5 231 aa6.87□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 BHMT2Q9H2M3 363 aa6.87□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM204AQ9H8W3 233 aa6.87□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 IMPACTQ9P2X3 320 aa6.87□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 RWDD3Q9Y3V2 267 aa6.87□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 CEP290O15078 2479 aa6.87□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 THSD7BQ9C0I4 1608 aa6.87□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 MSL3P1P0C860 447 aa6.86□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 SETSIPP0DME0 302 aa6.86□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 TM4SF4P48230 202 aa6.86□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 POU5F1BQ06416 359 aa6.86□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC14A2Q15849 920 aa6.86□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP6.86□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 UAP1L1Q3KQV9 507 aa6.86□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 CCDC62Q6P9F0 684 aa6.86□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 EP400NLQ6ZTU2 488 aa6.86□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa6.86□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 LRFN3Q9BTN0 628 aa6.86□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 APOL5Q9BWW9 433 aa6.86□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM60Q9H2L4 133 aa6.86□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 KCNK12Q9HB15 430 aa6.86□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 POLHQ9Y253 713 aa6.86□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa6.85□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa6.85□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 C5P01031 1676 aa6.85□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 PRSS38A1L453 326 aa6.85□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 H3BML4 177 aa6.85□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC27A2O14975 620 aa6.85□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 B3GALT2O43825 422 aa6.85□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 UBXN7O94888 489 aa6.85□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 SDHBP21912 280 aa6.85□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 SDHAP31040 664 aa6.85□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 FNTBP49356 437 aa6.85□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 KRT72Q14CN4 511 aa6.85□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 KIAA0753Q2KHM9 967 aa6.85□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 KCTD1Q719H9 257 aa6.85□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 DENND1CQ8IV53 801 aa6.85□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 NLGN4XQ8N0W4 816 aa6.85□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 CAMKK1Q8N5S9 505 aa6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.5 ms