RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478603.5

C9orf3-216, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf3, Length 802 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-216ENST00000478603 CABP7Q86V35 215 aa25.25■■□□□ 1.63
C9orf3-216ENST00000478603 PPFIBP1Q86W92 1011 aa25.25■■□□□ 1.63
C9orf3-216ENST00000478603 RIPOR3Q96MK2 946 aa25.25■■□□□ 1.63
C9orf3-216ENST00000478603 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa25.25■■□□□ 1.63
C9orf3-216ENST00000478603 FZD8Q9H461 694 aa25.25■■□□□ 1.63
C9orf3-216ENST00000478603 STK39Q9UEW8 545 aa25.25■■□□□ 1.63
C9orf3-216ENST00000478603 LRWD1Q9UFC0 647 aa25.25■■□□□ 1.63
C9orf3-216ENST00000478603 NR2E1Q9Y466 385 aa25.25■■□□□ 1.63
C9orf3-216ENST00000478603 C2orf16Q68DN1 1984 aa25.25■■□□□ 1.63
C9orf3-216ENST00000478603 URODP06132 367 aa25.24■■□□□ 1.63
C9orf3-216ENST00000478603 LIG1P18858 919 aa25.24■■□□□ 1.63
C9orf3-216ENST00000478603 CLCN4P51793 760 aa25.24■■□□□ 1.63
C9orf3-216ENST00000478603 PTGDRQ13258 359 aa25.24■■□□□ 1.63
C9orf3-216ENST00000478603 TMC5Q6UXY8 1006 aa25.24■■□□□ 1.63
C9orf3-216ENST00000478603 RABGGTAQ92696 567 aa25.24■■□□□ 1.63
C9orf3-216ENST00000478603 PRIMPOLQ96LW4 560 aa25.24■■□□□ 1.63
C9orf3-216ENST00000478603 FBXL18Q96ME1 805 aa25.24■■□□□ 1.63
C9orf3-216ENST00000478603 DENND4AQ7Z401 1863 aa25.23■■□□□ 1.63
C9orf3-216ENST00000478603 EFEMP2O95967 443 aa25.23■■□□□ 1.63
C9orf3-216ENST00000478603 EDN1P05305 212 aa25.23■■□□□ 1.63
C9orf3-216ENST00000478603 RABEP1Q15276 862 aa25.23■■□□□ 1.63
C9orf3-216ENST00000478603 PTPN21Q16825 1174 aa25.23■■□□□ 1.63
C9orf3-216ENST00000478603 FAM187BQ17R55 369 aa25.23■■□□□ 1.63
C9orf3-216ENST00000478603 TMEM132AQ24JP5 1023 aa25.23■■□□□ 1.63
C9orf3-216ENST00000478603 KIAA1841Q6NSI8 718 aa25.23■■□□□ 1.63
C9orf3-216ENST00000478603 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
C9orf3-216ENST00000478603 PBXIP1Q96AQ6 731 aa25.23■■□□□ 1.63
C9orf3-216ENST00000478603 MFSD14AQ96MC6 490 aa25.23■■□□□ 1.63
C9orf3-216ENST00000478603 KIFC3Q9BVG8 833 aa25.23■■□□□ 1.63
C9orf3-216ENST00000478603 C2orf40Q9H1Z8 148 aa25.23■■□□□ 1.63
C9orf3-216ENST00000478603 BHMT2Q9H2M3 363 aa25.23■■□□□ 1.63
C9orf3-216ENST00000478603 PDZD7Q9H5P4 517 aa25.23■■□□□ 1.63
C9orf3-216ENST00000478603 CACNG4Q9UBN1 327 aa25.23■■□□□ 1.63
C9orf3-216ENST00000478603 KIAA1024Q9UPX6 916 aa25.23■■□□□ 1.63
C9orf3-216ENST00000478603 SPDYE4A6NLX3 237 aa25.22■■□□□ 1.63
C9orf3-216ENST00000478603 PRKCBP05771 671 aa25.22■■□□□ 1.63
C9orf3-216ENST00000478603 MUTP22033 750 aa25.22■■□□□ 1.63
C9orf3-216ENST00000478603 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
C9orf3-216ENST00000478603 ATAT1Q5SQI0 421 aa25.22■■□□□ 1.63
C9orf3-216ENST00000478603 ZBTB33Q86T24 672 aa25.22■■□□□ 1.63
C9orf3-216ENST00000478603 DEPTORQ8TB45 409 aa25.22■■□□□ 1.63
C9orf3-216ENST00000478603 B3GALT6Q96L58 329 aa25.22■■□□□ 1.63
C9orf3-216ENST00000478603 RPS6KC1Q96S38 1066 aa25.22■■□□□ 1.63
C9orf3-216ENST00000478603 CCDC113Q9H0I3 377 aa25.22■■□□□ 1.63
C9orf3-216ENST00000478603 SFXN1Q9H9B4 322 aa25.22■■□□□ 1.63
C9orf3-216ENST00000478603 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
C9orf3-216ENST00000478603 NR1I2O75469 434 aa25.21■■□□□ 1.63
C9orf3-216ENST00000478603 NAMPTP43490 491 aa25.21■■□□□ 1.63
C9orf3-216ENST00000478603 GLUD2P49448 558 aa25.21■■□□□ 1.63
C9orf3-216ENST00000478603 SIGLEC14Q08ET2 396 aa25.21■■□□□ 1.63
C9orf3-216ENST00000478603 GRIK3Q13003 919 aa25.21■■□□□ 1.63
C9orf3-216ENST00000478603 MAPK6Q16659 721 aa25.21■■□□□ 1.63
C9orf3-216ENST00000478603 KIAA0319Q5VV43 1072 aa25.21■■□□□ 1.63
C9orf3-216ENST00000478603 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa25.21■■□□□ 1.63
C9orf3-216ENST00000478603 IGSF22Q8N9C0 903 aa25.21■■□□□ 1.63
C9orf3-216ENST00000478603 SNX29Q8TEQ0 813 aa25.21■■□□□ 1.63
C9orf3-216ENST00000478603 COLEC11Q9BWP8 271 aa25.21■■□□□ 1.63
C9orf3-216ENST00000478603 SNTG2Q9NY99 539 aa25.21■■□□□ 1.63
C9orf3-216ENST00000478603 PP2D1A8MPX8 630 aa25.2■■□□□ 1.62
C9orf3-216ENST00000478603 N4BP3O15049 544 aa25.2■■□□□ 1.62
C9orf3-216ENST00000478603 TEX28O15482 410 aa25.2■■□□□ 1.62
C9orf3-216ENST00000478603 MYBP10242 640 aa25.2■■□□□ 1.62
C9orf3-216ENST00000478603 PDIA5Q14554 519 aa25.2■■□□□ 1.62
C9orf3-216ENST00000478603 IL17AQ16552 155 aa25.2■■□□□ 1.62
C9orf3-216ENST00000478603 GPR62Q9BZJ7 368 aa25.2■■□□□ 1.62
C9orf3-216ENST00000478603 CXCL16Q9H2A7 254 aa25.2■■□□□ 1.62
C9orf3-216ENST00000478603 TRIP11Q15643 1979 aa25.2■■□□□ 1.62
C9orf3-216ENST00000478603 ACKR2O00590 384 aa25.19■■□□□ 1.62
C9orf3-216ENST00000478603 ST18O60284 1047 aa25.19■■□□□ 1.62
C9orf3-216ENST00000478603 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
C9orf3-216ENST00000478603 CDC25AP30304 524 aa25.19■■□□□ 1.62
C9orf3-216ENST00000478603 DSG1Q02413 1049 aa25.19■■□□□ 1.62
C9orf3-216ENST00000478603 PPP2R5AQ15172 486 aa25.19■■□□□ 1.62
C9orf3-216ENST00000478603 EEF1DP3Q658K8 133 aa25.19■■□□□ 1.62
C9orf3-216ENST00000478603 MCTP1Q6DN14 999 aa25.19■■□□□ 1.62
C9orf3-216ENST00000478603 FUT10Q6P4F1 479 aa25.19■■□□□ 1.62
C9orf3-216ENST00000478603 GPR149Q86SP6 731 aa25.19■■□□□ 1.62
C9orf3-216ENST00000478603 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
C9orf3-216ENST00000478603 KREMEN2Q8NCW0 462 aa25.19■■□□□ 1.62
C9orf3-216ENST00000478603 ASIC4Q96FT7 647 aa25.19■■□□□ 1.62
C9orf3-216ENST00000478603 PAAF1Q9BRP4 392 aa25.19■■□□□ 1.62
C9orf3-216ENST00000478603 MAN1C1Q9NR34 630 aa25.19■■□□□ 1.62
C9orf3-216ENST00000478603 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa25.19■■□□□ 1.62
C9orf3-216ENST00000478603 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa25.18■■□□□ 1.62
C9orf3-216ENST00000478603 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa25.18■■□□□ 1.62
C9orf3-216ENST00000478603 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
C9orf3-216ENST00000478603 E9PMD0 336 aa25.18■■□□□ 1.62
C9orf3-216ENST00000478603 ADH1AP07327 375 aa25.18■■□□□ 1.62
C9orf3-216ENST00000478603 TMX3Q96JJ7 454 aa25.18■■□□□ 1.62
C9orf3-216ENST00000478603 IFT74Q96LB3 600 aa25.18■■□□□ 1.62
C9orf3-216ENST00000478603 RAB34Q9BZG1 259 aa25.18■■□□□ 1.62
C9orf3-216ENST00000478603 RXFP1Q9HBX9 757 aa25.18■■□□□ 1.62
C9orf3-216ENST00000478603 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
C9orf3-216ENST00000478603 CHST7Q9NS84 486 aa25.18■■□□□ 1.62
C9orf3-216ENST00000478603 ADAM28Q9UKQ2 775 aa25.18■■□□□ 1.62
C9orf3-216ENST00000478603 KMT2EQ8IZD2 1858 aa25.17■■□□□ 1.62
C9orf3-216ENST00000478603 CASTOR2A6NHX0 329 aa25.17■■□□□ 1.62
C9orf3-216ENST00000478603 PTGESO14684 152 aa25.17■■□□□ 1.62
C9orf3-216ENST00000478603 RECQL4O94761 1208 aa25.17■■□□□ 1.62
C9orf3-216ENST00000478603 ASGR2P07307 311 aa25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms