RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470089.5

FBXO18-208, Transcript of F-box DNA helicase 1, human

TSL 5

Gene FBXO18, Length 979 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO18-208	ENST00000470089	INPPL1	O15357	1258 aa		32.23	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	NCK2	O43639	380 aa		32.23	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	32.23	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		32.23	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	TMC7	Q7Z402	723 aa		32.23	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	IGSF21	Q96ID5	467 aa		32.23	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	32.23	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	REEP2	Q9BRK0	252 aa		32.23	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		32.23	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	TLE6	Q9H808	572 aa		32.23	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	SNTG2	Q9NY99	539 aa		32.23	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	LTBR	P36941	435 aa		32.22	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	32.22	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		32.22	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	32.22	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	32.22	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	32.22	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	32.22	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	F13A1	P00488	732 aa		32.21	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		32.21	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		32.21	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	32.21	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		32.21	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	32.21	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		32.21	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	32.21	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		32.21	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		32.21	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	32.21	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	HIDE1	A8MVS5	230 aa		32.2	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	NRP1	O14786	923 aa		32.2	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	ALDH2	P05091	517 aa		32.2	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	32.2	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	CA8	P35219	290 aa		32.2	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	TXLNA	P40222	546 aa		32.2	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	ADAM15	Q13444	863 aa		32.2	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	CLUL1	Q15846	466 aa		32.2	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		32.2	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		32.2	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	VPS52	Q8N1B4	723 aa		32.2	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	32.2	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	32.2	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	32.2	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	32.2	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	32.2	■■■□□ 2.75
FBXO18-208	ENST00000470089	CARNS1	A5YM72	827 aa		32.19	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	TBX10	O75333	385 aa		32.19	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	RECQL4	O94761	1208 aa		32.19	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	OR1G1	P47890	313 aa		32.19	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	SMTN	P53814	917 aa		32.19	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	EFHB	Q8N7U6	833 aa		32.19	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		32.19	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		32.19	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	32.19	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		32.19	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		32.19	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	GDA	Q9Y2T3	454 aa		32.19	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		32.19	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	SPTLC2	O15270	562 aa		32.18	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	32.18	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	DDIT3	P35638	169 aa		32.18	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	NDUFV1	P49821	464 aa		32.18	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	32.18	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	DSC1	Q08554	894 aa		32.18	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	GIT2	Q14161	759 aa		32.18	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	32.18	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		32.18	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	32.18	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		32.18	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	PANK2	Q9BZ23	570 aa		32.18	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		32.18	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		32.18	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	32.18	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	TRIP11	Q15643	1979 aa		32.18	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	FAM13A	O94988	1023 aa		32.17	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	DUSP6	Q16828	381 aa		32.17	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	32.17	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	ZBTB33	Q86T24	672 aa		32.17	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		32.17	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	ZBP1	Q9H171	429 aa		32.17	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	CDT1	Q9H211	546 aa		32.17	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	STK17A	Q9UEE5	414 aa		32.17	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	32.17	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		32.17	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	CXCL14	O95715	111 aa		32.16	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	GLP2R	O95838	553 aa		32.16	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	32.16	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	GRIK3	Q13003	919 aa		32.16	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	STRN3	Q13033	797 aa		32.16	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		32.16	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	MYCT1	Q8N699	235 aa		32.16	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	MARCH5	Q9NX47	278 aa		32.16	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		32.16	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089		A0A087X0B3	334 aa		32.15	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089		F8W810	466 aa		32.15	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	IL9	P15248	144 aa		32.15	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	NCKAP1L	P55160	1127 aa		32.15	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	32.15	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	CEP120	Q8N960	986 aa		32.15	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	32.15	■■■□□ 2.74

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