RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462357.1

IMP4-209, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 5

Gene IMP4, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-209ENST00000462357 CLDN3O15551 220 aa22.56■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 MCF2P10911 925 aa22.56■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 LIG4P49917 911 aa22.56■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 PLCB3Q01970 1234 aa22.56■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 ZNF568Q3ZCX4 644 aa22.56■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 NT5DC1Q5TFE4 455 aa22.56■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 MPZL3Q6UWV2 235 aa22.56■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 PPM1EQ8WY54 764 aa22.56■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 HVCN1Q96D96 273 aa22.56■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 TMEM169Q96HH4 297 aa22.56■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa22.56■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 PANK4Q9NVE7 773 aa22.56■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 TBC1D13Q9NVG8 400 aa22.56■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 KBTBD4Q9NVX7 518 aa22.56■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 TBX20Q9UMR3 447 aa22.56■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 GBF1Q92538 1859 aa22.56■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 FSD2A1L4K1 749 aa22.55■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP22.55■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 FGF18O76093 207 aa22.55■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 BCAR1P56945 870 aa22.55■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 SLFN12LQ6IEE8 588 aa22.55■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 GAD1Q99259 594 aa22.55■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 FAN1Q9Y2M0 1017 aa22.55■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 HES2Q9Y543 173 aa22.55■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 A0A1W2PQ27 194 aa22.54■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 A0A1W2PQ64 194 aa22.54■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 A0A1W2PQD8 194 aa22.54■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa22.54■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 INPPL1O15357 1258 aa22.54■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 POMCP01189 267 aa22.54■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 LINC00271P0C7V0 271 aa22.54■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 AKAP5P24588 427 aa22.54■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 MLH1P40692 756 aa22.54■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 GTF2BQ00403 316 aa22.54■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 LRRC55Q6ZSA7 311 aa22.54■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 SPRED2Q7Z698 418 aa22.54■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 SPPL3Q8TCT6 385 aa22.54■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 ACAP3Q96P50 834 aa22.54■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 GBP3Q9H0R5 595 aa22.54■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 OLFML3Q9NRN5 406 aa22.54■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 PTPRSQ13332 1948 aa22.54■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 ITGB1P05556 798 aa22.53■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 MYL1P05976 194 aa22.53■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 SLFN14P0C7P3 912 aa22.53■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 GRIK3Q13003 919 aa22.53■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 E2F4Q16254 413 aa22.53■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 ZNF720Q7Z2F6 126 aa22.53■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 TMEM87AQ8NBN3 555 aa22.53■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 LRRC15Q8TF66 581 aa22.53■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 POF1BQ8WVV4 589 aa22.53■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 COLEC11Q9BWP8 271 aa22.53■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 RNF39Q9H2S5 420 aa22.53■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 TLR9Q9NR96 1032 aa22.53■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 SNTG2Q9NY99 539 aa22.53■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 A0A087X0B3 334 aa22.52■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 GRM6O15303 877 aa22.52■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 THP07101 528 aa22.52■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 GRM5P41594 1212 aa22.52■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 SYKP43405 635 aa22.52■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 ASIC1P78348 528 aa22.52■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP22.52■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 POSTNQ15063 836 aa22.52■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 AAK1Q2M2I8 961 aa22.52■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 CNNM4Q6P4Q7 775 aa22.52■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 ZBTB33Q86T24 672 aa22.52■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 DNAJC19Q96DA6 116 aa22.52■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 ACCSQ96QU6 501 aa22.52■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 C7orf25Q9BPX7 421 aa22.52■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 TRIM9Q9C026 710 aa22.52■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa22.52■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 TMEM206Q9H813 350 aa22.52■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 PTPRHQ9HD43 1115 aa22.52■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa22.52■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 COG5Q9UP83 839 aa22.52■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 GDAQ9Y2T3 454 aa22.52■■□□□ 1.2
IMP4-209ENST00000462357 MEIS3P2A8K0S8 358 aa22.51■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 GCNT3O95395 438 aa22.51■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 GALTP07902 379 aa22.51■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 EEF1DP3Q658K8 133 aa22.51■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 KANK3Q6NY19 840 aa22.51■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 SFR1Q86XK3 245 aa22.51■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 SYCP3Q8IZU3 236 aa22.51■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 SLC38A7Q9NVC3 462 aa22.51■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 CHMP5Q9NZZ3 219 aa22.51■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 A0A1B0GVL5 298 aa22.5■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa22.5■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 TTLL13PA6NNM8 815 aa22.5■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 RECQL4O94761 1208 aa22.5■■□□□ 1.19
IMP4-209ENST00000462357 PIGRP01833 764 aa22.5■■□□□ 1.19
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