RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454716.1

RPS3AP53-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 53, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP53, Length 778 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP53-201ENST00000454716 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
RPS3AP53-201ENST00000454716 NINLQ9Y2I6 1382 aa7.33□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 LMO7Q8WWI1 1683 aa7.33□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 DAPK3O43293 454 aa7.33□□□□□ -1.24
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RPS3AP53-201ENST00000454716 ADAM15Q13444 863 aa7.33□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 RIN1Q13671 783 aa7.33□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 PIK3R6Q5UE93 754 aa7.33□□□□□ -1.24
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RPS3AP53-201ENST00000454716 SH3TC2Q8TF17 1288 aa7.33□□□□□ -1.24
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RPS3AP53-201ENST00000454716 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa7.33□□□□□ -1.24
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RPS3AP53-201ENST00000454716 CAPN14A8MX76 684 aa7.32□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 ADCY7P51828 1080 aa7.32□□□□□ -1.24
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RPS3AP53-201ENST00000454716 PCED1AQ9H1Q7 454 aa7.32□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 TMEM260Q9NX78 707 aa7.32□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 ITSN1Q15811 1721 aa7.32□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa7.31□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa7.31□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 NPIPB8E9PQR5 432 aa7.31□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 CBX4O00257 560 aa7.31□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 TRAF5O00463 557 aa7.31□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 ZNF202O95125 648 aa7.31□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 GCP02774 474 aa7.31□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 RGS3P49796 1198 aa7.31□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 SQSTM1Q13501 440 aa7.31□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa7.31□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 OVOS2Q6IE36 1432 aa7.31□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 ZNF662Q6ZS27 426 aa7.31□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 KIF18BQ86Y91 864 aa7.31□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa7.31□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 PASD1Q8IV76 773 aa7.31□□□□□ -1.24
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RPS3AP53-201ENST00000454716 C16orf92Q96LL3 132 aa7.31□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 WDR92Q96MX6 357 aa7.31□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 PEAK1Q9H792 1746 aa7.31□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa7.31□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 CASZ1Q86V15 1759 aa7.31□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 CRB1P82279 1406 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 SUV39H1O43463 412 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 SLPIP03973 132 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 JMJD7P0C870 316 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 TGFB2P61812 414 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 TCEA2Q15560 299 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 MAN2A1Q16706 1144 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 TMEM176AQ96HP8 235 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 DYDC2Q96IM9 177 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 PARPBPQ9NWS1 579 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 SPO11Q9Y5K1 396 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 PLSCR1O15162 318 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 GAS7O60861 476 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 ASMTLO95671 621 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 BPIFB4P59827 614 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 PURAQ00577 322 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 CRHR2Q13324 411 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 TCIRG1Q13488 830 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 DDB1Q16531 1140 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 ORAI3Q9BRQ5 295 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 IFT57Q9NWB7 429 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 LRRC37A3O60309 1634 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 MYOM1P52179 1685 aa7.28□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 KRTAP23-1A1A580 65 aa7.28□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 DVL2O14641 736 aa7.28□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 PEX11BO96011 259 aa7.28□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 ADCY2Q08462 1091 aa7.28□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 ZNF460Q14592 562 aa7.28□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 KRT40Q6A162 431 aa7.28□□□□□ -1.24
RPS3AP53-201ENST00000454716 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa7.28□□□□□ -1.24
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