RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447402.7

SELENBP1-208, Transcript of selenium binding protein 1, human

TSL 2 BASIC

Gene SELENBP1, Length 1,530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SELENBP1-208	ENST00000447402	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		14.97	□□□□□ -0.01
SELENBP1-208	ENST00000447402	TGFB1I1	O43294	461 aa		14.97	□□□□□ -0.01
SELENBP1-208	ENST00000447402	STAG3L1	P0CL83	205 aa		14.97	□□□□□ -0.01
SELENBP1-208	ENST00000447402	MCF2	P10911	925 aa		14.97	□□□□□ -0.01
SELENBP1-208	ENST00000447402	ITGA4	P13612	1032 aa		14.97	□□□□□ -0.01
SELENBP1-208	ENST00000447402	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	14.97	□□□□□ -0.01
SELENBP1-208	ENST00000447402	PROZ	P22891	400 aa		14.97	□□□□□ -0.01
SELENBP1-208	ENST00000447402	AKAP5	P24588	427 aa		14.97	□□□□□ -0.01
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAM189B	P81408	668 aa		14.97	□□□□□ -0.01
SELENBP1-208	ENST00000447402	MCL1	Q07820	350 aa		14.97	□□□□□ -0.01
SELENBP1-208	ENST00000447402	SEZ6	Q53EL9	994 aa		14.97	□□□□□ -0.01
SELENBP1-208	ENST00000447402	HACE1	Q8IYU2	909 aa		14.97	□□□□□ -0.01
SELENBP1-208	ENST00000447402	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	14.97	□□□□□ -0.01
SELENBP1-208	ENST00000447402	TOP1MT	Q969P6	601 aa		14.97	□□□□□ -0.01
SELENBP1-208	ENST00000447402	PGBD4	Q96DM1	585 aa		14.97	□□□□□ -0.01
SELENBP1-208	ENST00000447402	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		14.97	□□□□□ -0.01
SELENBP1-208	ENST00000447402	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	14.97	□□□□□ -0.01
SELENBP1-208	ENST00000447402	SNTG2	Q9NY99	539 aa		14.97	□□□□□ -0.01
SELENBP1-208	ENST00000447402	PARP2	Q9UGN5	583 aa		14.97	□□□□□ -0.01
SELENBP1-208	ENST00000447402	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	14.97	□□□□□ -0.01
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		14.96	□□□□□ -0.01
SELENBP1-208	ENST00000447402		A0A0B4J269	797 aa		14.96	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	ABLIM1	O14639	778 aa		14.96	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	PSMA7	O14818	248 aa		14.96	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF623	O75123	536 aa		14.96	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	14.96	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	EOMES	O95936	686 aa		14.96	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	14.96	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	ADSS	P30520	456 aa		14.96	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	NLRP12	P59046	1061 aa		14.96	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	14.96	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		14.96	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	TDH	Q8IZJ6	230 aa		14.96	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	ADSSL1	Q8N142	457 aa		14.96	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	CEP120	Q8N960	986 aa		14.96	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		14.96	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	RNF39	Q9H2S5	420 aa		14.96	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		14.96	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		14.96	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	14.96	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		14.96	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		14.96	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	PDXK	O00764	312 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	OGT	O15294	1046 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	14.95	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	FGFR1	P11362	822 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	GART	P22102	1010 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	PPP1R2	P41236	205 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	ACOT2	P49753	483 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	CYP2J2	P51589	502 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	ABI1	Q8IZP0	508 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	SAAL1	Q96ER3	474 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	ACAP3	Q96P50	834 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC9A7	Q96T83	725 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	14.95	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	14.95	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	KLK14	Q9P0G3	267 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	PPP1R3G	B7ZBB8	358 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	14.94	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	RASIP1	Q5U651	963 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	TMEM192	Q8IY95	271 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	MLKL	Q8NB16	471 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	RDH13	Q8NBN7	331 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	NELFB	Q8WX92	580 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAM212A	Q96EL1	285 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	14.94	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	TSG101	Q99816	390 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	SYCE3	A1L190	88 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	TLL1	O43897	1013 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	RECQL4	O94761	1208 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	TNFSF9	P41273	254 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	GRM5	P41594	1212 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	GATM	P50440	423 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	STX17	P56962	302 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	CENPP	Q6IPU0	288 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		14.93	□□□□□ -0.02

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