RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TOP3B-206ENST00000436282 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa16■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 ACSL3O95573 720 aa15.99■□□□□ 0.15
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TOP3B-206ENST00000436282 UBXN2AP68543 259 aa15.99■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 MESDQ14696 234 aa15.99■□□□□ 0.15
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