RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428946.5

LRRC23-204, Transcript of leucine rich repeat containing 23, humanhuman

TSL 3

Gene LRRC23, Length 969 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23-204ENST00000428946 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa20.17■□□□□ 0.82
LRRC23-204ENST00000428946 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
LRRC23-204ENST00000428946 USP28Q96RU2 1077 aa20.17■□□□□ 0.82
LRRC23-204ENST00000428946 KIFC3Q9BVG8 833 aa20.17■□□□□ 0.82
LRRC23-204ENST00000428946 NT5C3AQ9H0P0 336 aa20.17■□□□□ 0.82
LRRC23-204ENST00000428946 USP20Q9Y2K6 914 aa20.17■□□□□ 0.82
LRRC23-204ENST00000428946 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
LRRC23-204ENST00000428946 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa20.17■□□□□ 0.82
LRRC23-204ENST00000428946 TTLL13PA6NNM8 815 aa20.16■□□□□ 0.82
LRRC23-204ENST00000428946 HIP1RO75146 1068 aa20.16■□□□□ 0.82
LRRC23-204ENST00000428946 EPCAMP16422 314 aa20.16■□□□□ 0.82
LRRC23-204ENST00000428946 LIG1P18858 919 aa20.16■□□□□ 0.82
LRRC23-204ENST00000428946 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
LRRC23-204ENST00000428946 SPECC1Q5M775 1068 aa20.16■□□□□ 0.82
LRRC23-204ENST00000428946 KANK3Q6NY19 840 aa20.16■□□□□ 0.82
LRRC23-204ENST00000428946 HFE2Q6ZVN8 426 aa20.16■□□□□ 0.82
LRRC23-204ENST00000428946 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa20.16■□□□□ 0.82
LRRC23-204ENST00000428946 DAW1Q8N136 415 aa20.16■□□□□ 0.82
LRRC23-204ENST00000428946 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
LRRC23-204ENST00000428946 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
LRRC23-204ENST00000428946 TMEM87AQ8NBN3 555 aa20.16■□□□□ 0.82
LRRC23-204ENST00000428946 DEPTORQ8TB45 409 aa20.16■□□□□ 0.82
LRRC23-204ENST00000428946 FEZF2Q8TBJ5 459 aa20.16■□□□□ 0.82
LRRC23-204ENST00000428946 LRRC15Q8TF66 581 aa20.16■□□□□ 0.82
LRRC23-204ENST00000428946 IFT74Q96LB3 600 aa20.16■□□□□ 0.82
LRRC23-204ENST00000428946 GAD1Q99259 594 aa20.16■□□□□ 0.82
LRRC23-204ENST00000428946 CSRNP2Q9H175 543 aa20.16■□□□□ 0.82
LRRC23-204ENST00000428946 FZD8Q9H461 694 aa20.16■□□□□ 0.82
LRRC23-204ENST00000428946 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
LRRC23-204ENST00000428946 SFI1A8K8P3 1242 aa20.15■□□□□ 0.82
LRRC23-204ENST00000428946 PLA2G4BP0C869 781 aa20.15■□□□□ 0.82
LRRC23-204ENST00000428946 SCNN1GP51170 649 aa20.15■□□□□ 0.82
LRRC23-204ENST00000428946 SLC12A3P55017 1021 aa20.15■□□□□ 0.82
LRRC23-204ENST00000428946 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa20.15■□□□□ 0.82
LRRC23-204ENST00000428946 KARSQ15046 597 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
LRRC23-204ENST00000428946 PTPN14Q15678 1187 aa20.15■□□□□ 0.82
LRRC23-204ENST00000428946 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
LRRC23-204ENST00000428946 USP49Q70CQ1 688 aa20.15■□□□□ 0.82
LRRC23-204ENST00000428946 ZFP42Q96MM3 310 aa20.15■□□□□ 0.82
LRRC23-204ENST00000428946 CLIC6Q96NY7 704 aa20.15■□□□□ 0.82
LRRC23-204ENST00000428946 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
LRRC23-204ENST00000428946 C2orf40Q9H1Z8 148 aa20.15■□□□□ 0.82
LRRC23-204ENST00000428946 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa20.15■□□□□ 0.82
LRRC23-204ENST00000428946 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
LRRC23-204ENST00000428946 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
LRRC23-204ENST00000428946 TRIOO75962 3097 aa20.14■□□□□ 0.82
LRRC23-204ENST00000428946 PLXNA3P51805 1871 aa20.14■□□□□ 0.81
LRRC23-204ENST00000428946 A0A1B0GUA9 196 aa20.14■□□□□ 0.81
LRRC23-204ENST00000428946 ARL5CA6NH57 179 aa20.14■□□□□ 0.81
LRRC23-204ENST00000428946 NRP1O14786 923 aa20.14■□□□□ 0.81
LRRC23-204ENST00000428946 NPTXRO95502 500 aa20.14■□□□□ 0.81
LRRC23-204ENST00000428946 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
LRRC23-204ENST00000428946 PEX3P56589 373 aa20.14■□□□□ 0.81
LRRC23-204ENST00000428946 MAPK7Q13164 816 aa20.14■□□□□ 0.81
LRRC23-204ENST00000428946 PPP2R5AQ15172 486 aa20.14■□□□□ 0.81
LRRC23-204ENST00000428946 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa20.14■□□□□ 0.81
LRRC23-204ENST00000428946 KCTD17Q8N5Z5 321 aa20.14■□□□□ 0.81
LRRC23-204ENST00000428946 CNNM3Q8NE01 707 aa20.14■□□□□ 0.81
LRRC23-204ENST00000428946 CCDC51Q96ER9 411 aa20.14■□□□□ 0.81
LRRC23-204ENST00000428946 CALML4Q96GE6 196 aa20.14■□□□□ 0.81
LRRC23-204ENST00000428946 EPSTI1Q96J88 318 aa20.14■□□□□ 0.81
LRRC23-204ENST00000428946 CCDC113Q9H0I3 377 aa20.14■□□□□ 0.81
LRRC23-204ENST00000428946 POMKQ9H5K3 350 aa20.14■□□□□ 0.81
LRRC23-204ENST00000428946 MARCH5Q9NX47 278 aa20.14■□□□□ 0.81
LRRC23-204ENST00000428946 MIOSQ9NXC5 875 aa20.14■□□□□ 0.81
LRRC23-204ENST00000428946 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
LRRC23-204ENST00000428946 FAN1Q9Y2M0 1017 aa20.14■□□□□ 0.81
LRRC23-204ENST00000428946 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
LRRC23-204ENST00000428946 MUC6Q6W4X9 2439 aa20.14■□□□□ 0.81
LRRC23-204ENST00000428946 ZNF318Q5VUA4 2279 aa20.14■□□□□ 0.81
LRRC23-204ENST00000428946 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa20.13■□□□□ 0.81
LRRC23-204ENST00000428946 CCDC169A6NNP5 214 aa20.13■□□□□ 0.81
LRRC23-204ENST00000428946 F8W810 466 aa20.13■□□□□ 0.81
LRRC23-204ENST00000428946 C2CD2LO14523 706 aa20.13■□□□□ 0.81
LRRC23-204ENST00000428946 EDN1P05305 212 aa20.13■□□□□ 0.81
LRRC23-204ENST00000428946 PRKCBP05771 671 aa20.13■□□□□ 0.81
LRRC23-204ENST00000428946 PLCG1P19174 1290 aa20.13■□□□□ 0.81
LRRC23-204ENST00000428946 AKAP5P24588 427 aa20.13■□□□□ 0.81
LRRC23-204ENST00000428946 OR1G1P47890 313 aa20.13■□□□□ 0.81
LRRC23-204ENST00000428946 NPTX2P47972 431 aa20.13■□□□□ 0.81
LRRC23-204ENST00000428946 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
LRRC23-204ENST00000428946 MAPK6Q16659 721 aa20.13■□□□□ 0.81
LRRC23-204ENST00000428946 FAM187BQ17R55 369 aa20.13■□□□□ 0.81
LRRC23-204ENST00000428946 TPRNQ4KMQ1 711 aa20.13■□□□□ 0.81
LRRC23-204ENST00000428946 ARSHQ5FYA8 562 aa20.13■□□□□ 0.81
LRRC23-204ENST00000428946 COLGALT2Q8IYK4 626 aa20.13■□□□□ 0.81
LRRC23-204ENST00000428946 EDAQ92838 391 aa20.13■□□□□ 0.81
LRRC23-204ENST00000428946 PRIMPOLQ96LW4 560 aa20.13■□□□□ 0.81
LRRC23-204ENST00000428946 TMEM175Q9BSA9 504 aa20.13■□□□□ 0.81
LRRC23-204ENST00000428946 KANSL3Q9P2N6 904 aa20.13■□□□□ 0.81
LRRC23-204ENST00000428946 C2orf16Q68DN1 1984 aa20.13■□□□□ 0.81
LRRC23-204ENST00000428946 DENND4AQ7Z401 1863 aa20.12■□□□□ 0.81
LRRC23-204ENST00000428946 CARNS1A5YM72 827 aa20.12■□□□□ 0.81
LRRC23-204ENST00000428946 ACKR2O00590 384 aa20.12■□□□□ 0.81
LRRC23-204ENST00000428946 SLC26A4O43511 780 aa20.12■□□□□ 0.81
LRRC23-204ENST00000428946 ALDH2P05091 517 aa20.12■□□□□ 0.81
LRRC23-204ENST00000428946 GUCY2CP25092 1073 aa20.12■□□□□ 0.81
LRRC23-204ENST00000428946 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
LRRC23-204ENST00000428946 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
LRRC23-204ENST00000428946 PKP1Q13835 747 aa20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms