RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427110.6

PTPRC-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 264 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-208ENST00000427110 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 FHL2Q14192 279 aa3.22□□□□□ -1.89
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PTPRC-208ENST00000427110 GAGE13Q4V321 117 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 FNDC7Q5VTL7 733 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 C1QL3Q5VWW1 255 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 TMPRSS6Q8IU80 811 aa3.22□□□□□ -1.89
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PTPRC-208ENST00000427110 FMNL3Q8IVF7 1028 aa3.22□□□□□ -1.89
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PTPRC-208ENST00000427110 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
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PTPRC-208ENST00000427110 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
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PTPRC-208ENST00000427110 EPC1Q9H2F5 836 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 MMRN2Q9H8L6 949 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 MSL2Q9HCI7 577 aa3.22□□□□□ -1.89
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PTPRC-208ENST00000427110 DPP7Q9UHL4 492 aa3.22□□□□□ -1.89
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PTPRC-208ENST00000427110 AKAP10O43572 662 aa3.21□□□□□ -1.9
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PTPRC-208ENST00000427110 RBP3P10745 1247 aa3.21□□□□□ -1.9
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PTPRC-208ENST00000427110 TMEM127O75204 238 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-208ENST00000427110 SCGB1D2O95969 90 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-208ENST00000427110 PF4V1P10720 104 aa3.2□□□□□ -1.9
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PTPRC-208ENST00000427110 GPR15P49685 360 aa3.2□□□□□ -1.9
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PTPRC-208ENST00000427110 ABHD18Q0P651 414 aa3.2□□□□□ -1.9
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PTPRC-208ENST00000427110 LRRC41Q15345 812 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-208ENST00000427110 UBE3CQ15386 1083 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-208ENST00000427110 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
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PTPRC-208ENST00000427110 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-208ENST00000427110 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
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PTPRC-208ENST00000427110 JADE3Q92613 823 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-208ENST00000427110 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-208ENST00000427110 CLIP3Q96DZ5 547 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-208ENST00000427110 HSPBAP1Q96EW2 488 aa3.2□□□□□ -1.9
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