RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 USP17L19D6RCP7 530 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 USP17L20D6RJB6 530 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 ASAP2O43150 1006 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 KRT14P02533 472 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 APOA1P02647 267 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 VAMP7P51809 220 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 KRT76Q01546 638 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 USP17L24Q0WX57 530 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 USP17L6PQ6QN14 398 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 MTBPQ96DY7 904 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 ACAP3Q96P50 834 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 WNT8AQ9H1J5 351 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 C5P01031 1676 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 POTEB3A0JP26 581 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 DENND3A2RUS2 1198 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 POTECB2RU33 542 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 PRELPP51888 382 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 KCNA1Q09470 495 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF568Q3ZCX4 644 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 IZUMO3Q5VZ72 239 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 POTEBQ6S5H4 581 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 RAD54LQ92698 747 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 RUBCNLQ9H714 662 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 KLC4Q9NSK0 619 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF212Q9UDV6 495 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 AMACRQ9UHK6 382 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa11.65□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC16A4O15374 487 aa11.65□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 ECT2Q9H8V3 914 aa11.65□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 POLD4Q9HCU8 107 aa11.65□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 IP6K2Q9UHH9 426 aa11.65□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 RASSF10A6NK89 507 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 USP27XA6NNY8 438 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 H7C1W4 665 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 STAT3P40763 770 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 LBRQ14739 615 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIM72Q6ZMU5 477 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 IFT43Q96FT9 208 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 SNF8Q96H20 258 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 GCNAQ96QF7 691 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF341Q9BYN7 854 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 CPVLQ9H3G5 476 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 EHD2Q9NZN4 543 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 HACD3Q9P035 362 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 VSNL1P62760 191 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 TNFAIP2Q03169 654 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 STAT4Q14765 748 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 MAPRE2Q15555 327 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 TTC23LQ6PF05 361 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 TBC1D10CQ8IV04 446 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 SCN4BQ8IWT1 228 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 STAG2Q8N3U4 1231 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 WNK3Q9BYP7 1800 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 COA1Q9GZY4 146 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 PDXDC1Q6P996 788 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 DCAF4Q8WV16 495 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 WDR19Q8NEZ3 1342 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 GGPS1O95749 300 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 IL10P22301 178 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 GNA15P30679 374 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 PGM1P36871 562 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 PHKA2P46019 1235 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 GUCY1A3Q02108 690 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 NCAPHQ15003 741 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 RASSF3Q86WH2 238 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 TTC39CQ8N584 583 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 OXER1Q8TDS5 423 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 GANCQ8TET4 914 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 HEG1Q9ULI3 1381 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 HADHAP40939 763 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 QARSP47897 775 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 SNAP25P60880 206 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 MAP3K10Q02779 954 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC27A3Q5K4L6 730 aa11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms