RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
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CCL20-202ENST00000409189 NHLH1Q02575 133 aa7.57□□□□□ -1.2
CCL20-202ENST00000409189 CLCQ05315 142 aa7.57□□□□□ -1.2
CCL20-202ENST00000409189 SLC14A2Q15849 920 aa7.57□□□□□ -1.2
CCL20-202ENST00000409189 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CCL20-202ENST00000409189 AKNAD1Q5T1N1 836 aa7.57□□□□□ -1.2
CCL20-202ENST00000409189 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CCL20-202ENST00000409189 Q6ZUG5 572 aa7.57□□□□□ -1.2
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CCL20-202ENST00000409189 STAG1Q8WVM7 1258 aa7.57□□□□□ -1.2
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CCL20-202ENST00000409189 SIGLEC10Q96LC7 697 aa7.57□□□□□ -1.2
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CCL20-202ENST00000409189 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
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CCL20-202ENST00000409189 STX6O43752 255 aa7.56□□□□□ -1.2
CCL20-202ENST00000409189 TRIM13O60858 407 aa7.56□□□□□ -1.2
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CCL20-202ENST00000409189 RTP1P59025 263 aa7.56□□□□□ -1.2
CCL20-202ENST00000409189 GSTO1P78417 241 aa7.56□□□□□ -1.2
CCL20-202ENST00000409189 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CCL20-202ENST00000409189 PKP1Q13835 747 aa7.56□□□□□ -1.2
CCL20-202ENST00000409189 DBX2Q6ZNG2 339 aa7.56□□□□□ -1.2
CCL20-202ENST00000409189 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CCL20-202ENST00000409189 TMEM192Q8IY95 271 aa7.56□□□□□ -1.2
CCL20-202ENST00000409189 IFNL3Q8IZI9 196 aa7.56□□□□□ -1.2
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CCL20-202ENST00000409189 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa7.56□□□□□ -1.2
CCL20-202ENST00000409189 BRF1Q92994 677 aa7.56□□□□□ -1.2
CCL20-202ENST00000409189 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CCL20-202ENST00000409189 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CCL20-202ENST00000409189 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CCL20-202ENST00000409189 KRT23Q9C075 422 aa7.56□□□□□ -1.2
CCL20-202ENST00000409189 CNTD2Q9H8S5 307 aa7.56□□□□□ -1.2
CCL20-202ENST00000409189 ARMT1Q9H993 441 aa7.56□□□□□ -1.2
CCL20-202ENST00000409189 CHST7Q9NS84 486 aa7.56□□□□□ -1.2
CCL20-202ENST00000409189 UBP1Q9NZI7 540 aa7.56□□□□□ -1.2
CCL20-202ENST00000409189 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CCL20-202ENST00000409189 ABCF2Q9UG63 623 aa7.56□□□□□ -1.2
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CCL20-202ENST00000409189 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa7.56□□□□□ -1.2
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CCL20-202ENST00000409189 PRC1O43663 620 aa7.55□□□□□ -1.2
CCL20-202ENST00000409189 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CCL20-202ENST00000409189 ZNF205O95201 554 aa7.55□□□□□ -1.2
CCL20-202ENST00000409189 APPP05067 770 aa7.55□□□□□ -1.2
CCL20-202ENST00000409189 PI3P19957 117 aa7.55□□□□□ -1.2
CCL20-202ENST00000409189 CYP2B6P20813 491 aa7.55□□□□□ -1.2
CCL20-202ENST00000409189 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CCL20-202ENST00000409189 VAMP1P23763 118 aa7.55□□□□□ -1.2
CCL20-202ENST00000409189 CTSKP43235 329 aa7.55□□□□□ -1.2
CCL20-202ENST00000409189 EPHB3P54753 998 aa7.55□□□□□ -1.2
CCL20-202ENST00000409189 HAND2P61296 217 aa7.55□□□□□ -1.2
CCL20-202ENST00000409189 MECOMQ03112 1051 aa7.55□□□□□ -1.2
CCL20-202ENST00000409189 SART3Q15020 963 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CCL20-202ENST00000409189 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CCL20-202ENST00000409189 GADL1Q6ZQY3 521 aa7.55□□□□□ -1.2
CCL20-202ENST00000409189 HS2ST1Q7LGA3 356 aa7.55□□□□□ -1.2
CCL20-202ENST00000409189 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
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CCL20-202ENST00000409189 SLITRK4Q8IW52 837 aa7.55□□□□□ -1.2
CCL20-202ENST00000409189 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa7.55□□□□□ -1.2
CCL20-202ENST00000409189 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
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CCL20-202ENST00000409189 ZNF341Q9BYN7 854 aa7.55□□□□□ -1.2
CCL20-202ENST00000409189 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CCL20-202ENST00000409189 ERVK13-1Q9NX77 482 aa7.55□□□□□ -1.2
CCL20-202ENST00000409189 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CCL20-202ENST00000409189 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CCL20-202ENST00000409189 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa7.55□□□□□ -1.2
CCL20-202ENST00000409189 ZDHHC9Q9Y397 364 aa7.55□□□□□ -1.2
CCL20-202ENST00000409189 ZNF318Q5VUA4 2279 aa7.55□□□□□ -1.2
CCL20-202ENST00000409189 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa7.54□□□□□ -1.2
CCL20-202ENST00000409189 TRIOO75962 3097 aa7.54□□□□□ -1.2
CCL20-202ENST00000409189 DCHS1Q96JQ0 3298 aa7.54□□□□□ -1.2
CCL20-202ENST00000409189 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa7.54□□□□□ -1.2
CCL20-202ENST00000409189 GOLGA8BA8MQT2 603 aa7.54□□□□□ -1.2
CCL20-202ENST00000409189 SMIM22K7EJ46 135 aa7.54□□□□□ -1.2
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