RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393386.6

PTPRZ1-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Z1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRZ1, Length 8,175 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1-201ENST00000393386 LVRNQ6Q4G3 990 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 SARM1Q6SZW1 724 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 MAGED4Q96JG8 741 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 ZNF652Q9Y2D9 606 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 BIRC5O15392 142 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 TJP3O95049 919 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 MED26O95402 600 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 P4HA1P13674 534 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 STK4Q13043 487 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 AKNAD1Q5T1N1 836 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 CDHR1Q96JP9 859 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 MNTQ99583 582 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 OSBPL8Q9BZF1 889 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 HPCAL4Q9UM19 191 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 NACAE9PAV3 2078 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 SLC27A2O14975 620 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 KLHL2O95198 593 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 IMPDH2P12268 514 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 TAC1P20366 129 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 FAM180AQ6UWF9 173 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 VSTM4Q8IW00 320 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 CERKQ8TCT0 537 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 DCAF5Q96JK2 942 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 STK17AQ9UEE5 414 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 MLXQ9UH92 298 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 C15orf41Q9Y2V0 281 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 MYO7BQ6PIF6 2116 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 KPNA7A9QM74 516 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 ASS1P00966 412 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 ATP4AP20648 1035 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 CACNA2D1P54289 1103 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 KDSRQ06136 332 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 TAF12Q16514 161 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 ARL13BQ3SXY8 428 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 TRIQKQ629K1 86 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 PACS2Q86VP3 889 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 KCTD17Q8N5Z5 321 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 ZBTB18Q99592 522 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 WWP1Q9H0M0 922 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 SLC52A2Q9HAB3 445 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 MYO3AQ8NEV4 1616 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 CCDC189A1A4V9 331 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 A8MXQ7 604 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 STMND1H3BQB6 276 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 KRT31Q15323 416 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 RHPN1Q8TCX5 695 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 XAGE3Q8WTP9 111 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 MAGEF1Q9HAY2 307 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 LRWD1Q9UFC0 647 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 ANGPT2O15123 496 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 CMA1P23946 247 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 TMOD1P28289 359 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 PRAMEP78395 509 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 TRIM67Q6ZTA4 783 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 PIGOQ8TEQ8 1089 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 RASSF5Q8WWW0 418 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 TMEM87BQ96K49 555 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 AZI2Q9H6S1 392 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa5.84□□□□□ -1.48
PTPRZ1-201ENST00000393386 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa5.84□□□□□ -1.48
PTPRZ1-201ENST00000393386 AREL1O15033 823 aa5.84□□□□□ -1.48
PTPRZ1-201ENST00000393386 PAMP19021 973 aa5.84□□□□□ -1.48
PTPRZ1-201ENST00000393386 TNFAIP2Q03169 654 aa5.84□□□□□ -1.48
PTPRZ1-201ENST00000393386 APOA5Q6Q788 366 aa5.84□□□□□ -1.48
PTPRZ1-201ENST00000393386 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa5.84□□□□□ -1.48
PTPRZ1-201ENST00000393386 AKAP14Q86UN6 197 aa5.84□□□□□ -1.48
PTPRZ1-201ENST00000393386 GALNT6Q8NCL4 622 aa5.84□□□□□ -1.48
PTPRZ1-201ENST00000393386 CEP95Q96GE4 821 aa5.84□□□□□ -1.48
PTPRZ1-201ENST00000393386 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP5.84□□□□□ -1.48
PTPRZ1-201ENST00000393386 RRN3Q9NYV6 651 aa5.84□□□□□ -1.48
PTPRZ1-201ENST00000393386 C2CD2Q9Y426 696 aa5.84□□□□□ -1.48
PTPRZ1-201ENST00000393386 GAS2O43903 313 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRZ1-201ENST00000393386 OATP04181 439 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRZ1-201ENST00000393386 H2AFZP0C0S5 128 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRZ1-201ENST00000393386 CCDC166P0CW27 439 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRZ1-201ENST00000393386 PFKFB1P16118 471 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRZ1-201ENST00000393386 KLHL38Q2WGJ6 581 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRZ1-201ENST00000393386 LAYNQ6UX15 382 aa5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms