RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 FBXO28Q9NVF7 368 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 MID2Q9UJV3 735 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 PIK3R2O00459 728 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 PSMD14O00487 310 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 HSPA4LO95757 839 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP18.29■□□□□ 0.522e-6■□□□□ 10.9
SH3BP4-202ENST00000392011 KRT17Q04695 432 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 CATSPER3Q86XQ3 398 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 PDZD8Q8NEN9 1154 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 TTC25Q96NG3 672 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 GOLPH3Q9H4A6 298 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 STAP1Q9ULZ2 295 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 CLGNO14967 610 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 FGFR4P22455 802 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF280CQ8ND82 737 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 SDCCAG3Q96C92 435 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 TUBB6Q9BUF5 446 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 CYP26B1Q9NR63 512 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 EPS15L1Q9UBC2 864 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 PIK3C2BO00750 1634 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 ART3Q13508 389 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 C1orf228Q6PIY5 440 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 SNF8Q96H20 258 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 TRIM51Q9BSJ1 452 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 NFIAQ12857 509 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 BARGINQ6ZT62 677 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 SH2D3CQ8N5H7 860 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 ADAM33Q9BZ11 813 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 IL1RL1Q01638 556 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 GUCY1A3Q02108 690 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 NME3Q13232 169 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 TRIM67Q6ZTA4 783 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 THEM5Q8N1Q8 247 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP18.28■□□□□ 0.524e-6■■■■■ 39.2
SH3BP4-202ENST00000392011 CTIFO43310 598 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 SMARCA1P28370 1054 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 ARSEP51690 589 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 TTC36A6NLP5 189 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 CD44P16070 742 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 NR1H3Q13133 447 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 KLHL38Q2WGJ6 581 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 TEX2Q8IWB9 1127 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 KLRC1P26715 233 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 OCRLQ01968 901 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 TTC1Q99614 292 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 H0Y3Z8 333 aa18.27■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 NAB2Q15742 525 aa18.27■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 MXRA8Q9BRK3 442 aa18.27■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 SIK2Q9H0K1 926 aa18.27■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 AGAP1Q9UPQ3 857 aa18.27■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 COG7P83436 770 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 TADA2BQ86TJ2 420 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 SEPT1Q8WYJ6 367 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 KCNH7Q9NS40 1196 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 SPDYE2BA6NHP3 402 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 DCTN3O75935 186 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 SPDYE6P0CI01 402 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 KITP10721 976 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 NCOA4Q13772 614 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 TAF11Q15544 211 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 NLRP14Q86W24 1093 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 ABCF3Q9NUQ8 709 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 KIF3CO14782 793 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 FGFR2P21802 821 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 AP3M2P53677 418 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 C18orf8Q96DM3 657 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC13A1Q9BZW2 595 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 LCMT1Q9UIC8 334 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 ADGRA1Q86SQ6 560 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 ATL2Q8NHH9 583 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 CYTH2Q99418 400 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 TIPINQ9BVW5 301 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 FSD1LQ9BXM9 530 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 SPAG7O75391 227 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 ROR1Q01973 937 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 KLC3Q6P597 504 aa18.25■□□□□ 0.51
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