RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384154.1

RNU6-190P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 190, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-190P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-190P-201ENST00000384154 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 DNM3Q9UQ16 869 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 NR2E1Q9Y466 385 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 GOLGA6CA6NDK9 693 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 GOLGA6BA6NDN3 693 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 VSTM5A8MXK1 200 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 MATN2O00339 956 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 DAPK3O43293 454 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 SUV39H1O43463 412 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 PRC1O43663 620 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 AKR1B10O60218 316 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 POU2F2P09086 479 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 GOLGA6DP0CG33 693 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 GYPEP15421 78 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 CRHR1P34998 444 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 GNALP38405 381 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 KIR2DL3P43628 341 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 SLC6A9P48067 706 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP4.06□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 EPHB4P54760 987 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 BPIFB4P59827 614 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 ADAM17P78536 824 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 UBE3CQ15386 1083 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 MINDY4Q4G0A6 757 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 NT5DC1Q5TFE4 455 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 FAM180AQ6UWF9 173 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 Q6ZVL8 140 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 USP45Q70EL2 814 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 DGKHQ86XP1 1220 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 TTC9BQ8N6N2 239 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP4.06□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 MVB12AQ96EY5 273 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 SAMD11Q96NU1 681 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 MEGF9Q9H1U4 602 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 BCO1Q9HAY6 547 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 PRDM11Q9NQV5 511 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 GPRC5DQ9NZD1 345 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 OAZ3Q9UMX2 235 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 H3BML4 177 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 MATN3O15232 486 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 ADCY6O43306 1168 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 SLC26A4O43511 780 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 GASTP01350 101 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 ITGB3P05106 788 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 GUCY1A2P33402 732 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 SREBF1P36956 1147 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 ADCY7P51828 1080 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 ZXDAP98168 799 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 CDC42EP1Q00587 391 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 DUSP2Q05923 314 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 KRTAP1-1Q07627 177 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 KIAA2012Q0VF49 1180 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP4.05□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP4.05□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 NOMO1Q15155 1222 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 PGS1Q32NB8 556 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 C14orf80Q86SX3 495 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 DENND1CQ8IV53 801 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 LGI4Q8N135 537 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 PRR18Q8N4B5 295 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 ANKRD53Q8N9V6 530 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 OR7D4Q8NG98 312 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 RABGGTAQ92696 567 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 DPF2Q92785 391 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 KAT5Q92993 513 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 LRGUKQ96M69 825 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 GPHA2Q96T91 129 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 GPR20Q99678 358 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 C7orf25Q9BPX7 421 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 PDCD2LQ9BRP1 358 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 ENKD1Q9H0I2 346 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 MANSC1Q9H8J5 431 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 SEC61A2Q9H9S3 476 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 IL23AQ9NPF7 189 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 LANCL2Q9NS86 450 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 C1orf112Q9NSG2 853 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 ING3Q9NXR8 418 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 OBP2AQ9NY56 170 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 SIK3Q9Y2K2 1263 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 AP1G1O43747 822 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 ITGA10O75578 1167 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 PDCP20941 246 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 RAC3P60763 192 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP4.04□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 DUSP8Q13202 625 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 RIN1Q13671 783 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 GALEQ14376 348 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 GRM3Q14832 879 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 UBXN11Q5T124 520 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-190P-201ENST00000384154 KRT40Q6A162 431 aa4.04□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms