RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 Q96MF0 132 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-202ENST00000367364 FOXJ2Q9P0K8 574 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-202ENST00000367364 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-202ENST00000367364 CDKL5O76039 1030 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-202ENST00000367364 CFIP05156 583 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-202ENST00000367364 A0A1W2PR48 441 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-202ENST00000367364 FAM221BA6H8Z2 402 aa6.17□□□□□ -1.42
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PTPRC-202ENST00000367364 Q6ZNX1 250 aa6.16□□□□□ -1.42
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PTPRC-202ENST00000367364 B5MCH6 92 aa6.15□□□□□ -1.42
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PTPRC-202ENST00000367364 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF460Q14592 562 aa6.14□□□□□ -1.43
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PTPRC-202ENST00000367364 AGAP9Q5VTM2 703 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF425Q6IV72 752 aa6.14□□□□□ -1.43
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PTPRC-202ENST00000367364 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
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PTPRC-202ENST00000367364 CHN2P52757 468 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-202ENST00000367364 MXRA7P84157 204 aa6.12□□□□□ -1.43
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PTPRC-202ENST00000367364 DEPDC7Q96QD5 511 aa6.12□□□□□ -1.43
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PTPRC-202ENST00000367364 ASLP04424 464 aa6.11□□□□□ -1.43
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PTPRC-202ENST00000367364 OR56A1Q8NGH5 318 aa6.11□□□□□ -1.43
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PTPRC-202ENST00000367364 KLHL11Q9NVR0 708 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-202ENST00000367364 ASB6Q9NWX5 421 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-202ENST00000367364 SLC17A6Q9P2U8 582 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-202ENST00000367364 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-202ENST00000367364 OPA1O60313 960 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-202ENST00000367364 ITGA10O75578 1167 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-202ENST00000367364 GPR15P49685 360 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-202ENST00000367364 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-202ENST00000367364 MFSD14BQ5SR56 506 aa6.09□□□□□ -1.43
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