RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366391.6

SH3BP5-201, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-201ENST00000366391 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SH3BP5-201ENST00000366391 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP5-201ENST00000366391 H3BQ06 376 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SH3BP5-201ENST00000366391 SLC16A4O15374 487 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP5-201ENST00000366391 LINC01565O15544 149 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP5-201ENST00000366391 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SH3BP5-201ENST00000366391 PLS3P13797 630 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP5-201ENST00000366391 NASPP49321 788 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SH3BP5-201ENST00000366391 SCNN1GP51170 649 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP5-201ENST00000366391 ADAM15Q13444 863 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP5-201ENST00000366391 MCM6Q14566 821 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP5-201ENST00000366391 TAS1R3Q7RTX0 852 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP5-201ENST00000366391 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SH3BP5-201ENST00000366391 GPBP1Q86WP2 473 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP5-201ENST00000366391 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SH3BP5-201ENST00000366391 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SH3BP5-201ENST00000366391 TLE6Q9H808 572 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP5-201ENST00000366391 PARP2Q9UGN5 583 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP5-201ENST00000366391 BDP1A6H8Y1 2624 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP5-201ENST00000366391 ALDH2P05091 517 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP5-201ENST00000366391 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
SH3BP5-201ENST00000366391 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
SH3BP5-201ENST00000366391 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
SH3BP5-201ENST00000366391 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP5-201ENST00000366391 ATF7IP2Q5U623 682 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP5-201ENST00000366391 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
SH3BP5-201ENST00000366391 TMC7Q7Z402 723 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP5-201ENST00000366391 COLGALT2Q8IYK4 626 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP5-201ENST00000366391 EFHBQ8N7U6 833 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP5-201ENST00000366391 GSTCDQ8NEC7 633 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP5-201ENST00000366391 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
SH3BP5-201ENST00000366391 SPIRE2Q8WWL2 714 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP5-201ENST00000366391 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
SH3BP5-201ENST00000366391 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
SH3BP5-201ENST00000366391 REEP2Q9BRK0 252 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP5-201ENST00000366391 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
SH3BP5-201ENST00000366391 SNTG2Q9NY99 539 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP5-201ENST00000366391 KLK14Q9P0G3 267 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP5-201ENST00000366391 KCNG1Q9UIX4 513 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP5-201ENST00000366391 ODF2LQ9ULJ1 636 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP5-201ENST00000366391 FAN1Q9Y2M0 1017 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP5-201ENST00000366391 C2orf16Q68DN1 1984 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP5-201ENST00000366391 HIDE1A8MVS5 230 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP5-201ENST00000366391 NRP1O14786 923 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP5-201ENST00000366391 PER2O15055 1255 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP5-201ENST00000366391 TBX10O75333 385 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP5-201ENST00000366391 DSC1Q08554 894 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP5-201ENST00000366391 STK38Q15208 465 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP5-201ENST00000366391 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SH3BP5-201ENST00000366391 VPS52Q8N1B4 723 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP5-201ENST00000366391 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SH3BP5-201ENST00000366391 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SH3BP5-201ENST00000366391 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SH3BP5-201ENST00000366391 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SH3BP5-201ENST00000366391 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SH3BP5-201ENST00000366391 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SH3BP5-201ENST00000366391 CCDC39Q9UFE4 941 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP5-201ENST00000366391 TNFSF13BQ9Y275 285 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP5-201ENST00000366391 MUC3AQ02505 3323 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP5-201ENST00000366391 RECQL4O94761 1208 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP5-201ENST00000366391 F13A1P00488 732 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP5-201ENST00000366391 TXLNAP40222 546 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP5-201ENST00000366391 SMTNP53814 917 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP5-201ENST00000366391 GRIK3Q13003 919 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP5-201ENST00000366391 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SH3BP5-201ENST00000366391 DUSP6Q16828 381 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP5-201ENST00000366391 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SH3BP5-201ENST00000366391 LINC00301Q8NCQ3 95 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP5-201ENST00000366391 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP5-201ENST00000366391 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SH3BP5-201ENST00000366391 RPS6KC1Q96S38 1066 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP5-201ENST00000366391 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SH3BP5-201ENST00000366391 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SH3BP5-201ENST00000366391 VN1R3Q9BXE9 311 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP5-201ENST00000366391 ZBP1Q9H171 429 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP5-201ENST00000366391 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SH3BP5-201ENST00000366391 STK17AQ9UEE5 414 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP5-201ENST00000366391 GLP2RO95838 553 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP5-201ENST00000366391 DDIT3P35638 169 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP5-201ENST00000366391 OR1G1P47890 313 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP5-201ENST00000366391 NDUFV1P49821 464 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP5-201ENST00000366391 PKP1Q13835 747 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP5-201ENST00000366391 GIT2Q14161 759 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP5-201ENST00000366391 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SH3BP5-201ENST00000366391 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SH3BP5-201ENST00000366391 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SH3BP5-201ENST00000366391 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SH3BP5-201ENST00000366391 CDT1Q9H211 546 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP5-201ENST00000366391 PTPRHQ9HD43 1115 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP5-201ENST00000366391 MARCH5Q9NX47 278 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP5-201ENST00000366391 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SH3BP5-201ENST00000366391 FSD2A1L4K1 749 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP5-201ENST00000366391 GRXCR2A6NFK2 248 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP5-201ENST00000366391 C2orf71A6NGG8 1288 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP5-201ENST00000366391 SPTLC2O15270 562 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP5-201ENST00000366391 FAM13AO94988 1023 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP5-201ENST00000366391 YEATS4O95619 227 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP5-201ENST00000366391 KRT18P05783 430 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SH3BP5-201ENST00000366391 CTSAP10619 480 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP5-201ENST00000366391 MAPTP10636 758 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms