RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362861.1

RNU6-1079P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1079, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1079P, Length 110 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LGALS4P56470 323 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ERVFC1-1P60608 527 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SPDYE7PQ495Y7 208 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1079P-201ENST00000362861 USP17L6PQ6QN14 398 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SLC34A3Q8N130 599 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP-0.22□□□□□ -2.44
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RNU6-1079P-201ENST00000362861 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
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RNU6-1079P-201ENST00000362861 SERGEFQ9UGK8 458 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1079P-201ENST00000362861 POU2F3Q9UKI9 436 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TENM4Q6N022 2769 aa-0.22□□□□□ -2.44
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RNU6-1079P-201ENST00000362861 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
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RNU6-1079P-201ENST00000362861 KRIT1O00522 736 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PEX1O43933 1283 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZG16O60844 167 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DGKIO75912 1065 aa-0.23□□□□□ -2.45
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RNU6-1079P-201ENST00000362861 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP-0.23□□□□□ -2.45
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RNU6-1079P-201ENST00000362861 STILQ15468 1287 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ANKRD39Q53RE8 183 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa-0.23□□□□□ -2.45
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RNU6-1079P-201ENST00000362861 AGMOQ6ZNB7 445 aa-0.23□□□□□ -2.45
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RNU6-1079P-201ENST00000362861 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FGFRL1Q8N441 504 aa-0.23□□□□□ -2.45
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RNU6-1079P-201ENST00000362861 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP-0.24□□□□□ -2.45
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RNU6-1079P-201ENST00000362861 UBXN6Q9BZV1 441 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 EPB41L1Q9H4G0 881 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TCF7L2Q9NQB0 619 aa-0.24□□□□□ -2.45
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RNU6-1079P-201ENST00000362861 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP-0.24□□□□□ -2.45
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RNU6-1079P-201ENST00000362861 PRRT4C9JH25 899 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 H7BY64 318 aa-0.25□□□□□ -2.45
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RNU6-1079P-201ENST00000362861 EPHA5P54756 1037 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MTMR3Q13615 1198 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF718Q3SXZ3 478 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KAZNQ674X7 775 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KRT40Q6A162 431 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LBX2Q6XYB7 198 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LNX2Q8N448 690 aa-0.25□□□□□ -2.45
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