RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 FAM92BQ6ZTR7 304 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 SP8Q8IXZ3 490 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 PYROXD1Q8WU10 500 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 NUDCD1Q96RS6 583 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF341Q9BYN7 854 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 CXorf56Q9H5V9 222 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 ASAP1Q9ULH1 1129 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 PCDHA7Q9UN72 937 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 FKBP9O95302 570 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 SYF2O95926 243 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
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PTPRD-201ENST00000355233 TUFMP49411 452 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
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PTPRD-201ENST00000355233 PPARAQ07869 468 aa5.2□□□□□ -1.58
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PTPRD-201ENST00000355233 CNGA3Q16281 694 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa5.2□□□□□ -1.58
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PTPRD-201ENST00000355233 CARD9Q9H257 536 aa5.2□□□□□ -1.58
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PTPRD-201ENST00000355233 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
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PTPRD-201ENST00000355233 KRT75O95678 551 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 POLR2MP0CAP2 368 aa5.2□□□□□ -1.58
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PTPRD-201ENST00000355233 KRT73Q86Y46 540 aa5.2□□□□□ -1.58
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PTPRD-201ENST00000355233 PARVGQ9HBI0 331 aa5.2□□□□□ -1.58
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PTPRD-201ENST00000355233 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa5.2□□□□□ -1.58
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PTPRD-201ENST00000355233 ABCB5Q2M3G0 1257 aa5.2□□□□□ -1.58
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PTPRD-201ENST00000355233 SLC30A5Q8TAD4 765 aa5.2□□□□□ -1.58
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PTPRD-201ENST00000355233 VCPKMTQ9H867 229 aa5.2□□□□□ -1.58
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PTPRD-201ENST00000355233 SAGE2PA6NJ88 616 aa5.2□□□□□ -1.58
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PTPRD-201ENST00000355233 DDR1Q08345 913 aa5.2□□□□□ -1.58
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PTPRD-201ENST00000355233 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
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