RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344548.7

CDC42-202, Transcript of cell division cycle 42, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CDC42, Length 2,256 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42-202ENST00000344548 H0YCG3 227 aa14.73□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 FAM189A1O60320 539 aa14.73□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.052e-7■■■■■ 32
CDC42-202ENST00000344548 CHMP4BP1P59074 171 aa14.73□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 HIC1Q14526 733 aa14.73□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 IQSEC1Q6DN90 963 aa14.73□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 ZBTB33Q86T24 672 aa14.73□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 LINC01465Q8N7H1 131 aa14.73□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 IFT122Q9HBG6 1241 aa14.73□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 DCAF8L1A6NGE4 600 aa14.73□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 ABLIM1O14639 778 aa14.73□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 EXTL3O43909 919 aa14.73□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 KIF5CO60282 957 aa14.73□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 EVI5O60447 810 aa14.73□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 IGHA2P01877 340 aa14.73□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 VTNP04004 478 aa14.73□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 PI4K2AQ9BTU6 479 aa14.73□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 STK33Q9BYT3 514 aa14.73□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa14.73□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 ACP6Q9NPH0 428 aa14.73□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 V9GYY5 206 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 ZNF233A6NK53 670 aa14.72□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 TM4SF4P48230 202 aa14.72□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 INHBEP58166 350 aa14.72□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 SPA17Q15506 151 aa14.72□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 CEP120Q8N960 986 aa14.72□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 TMC2Q8TDI7 906 aa14.72□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 TCP11Q8WWU5 503 aa14.72□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 KREMEN1Q96MU8 473 aa14.72□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 MSTO1Q9BUK6 570 aa14.72□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 SETD4Q9NVD3 440 aa14.72□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 A0A087WZ62 844 aa14.72□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 ENC1O14682 589 aa14.72□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 CTIFO43310 598 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 AOC2O75106 756 aa14.72□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 TUBB4AP04350 444 aa14.72□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 PRKCBP05771 671 aa14.72□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 MAGEA1P43355 309 aa14.72□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 SLC18A3Q16572 532 aa14.72□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 EEF1DP3Q658K8 133 aa14.72□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 KRT39Q6A163 491 aa14.72□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 TMEM130Q8N3G9 435 aa14.72□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 KAT2BQ92831 832 aa14.72□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 TATDN2Q93075 761 aa14.72□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 CCDC102AQ96A19 550 aa14.72□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 GABRQQ9UN88 632 aa14.72□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 PPME1Q9Y570 386 aa14.72□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa14.72□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa14.71□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 SOX5P35711 763 aa14.71□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 PRKCIP41743 596 aa14.71□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.056e-7■■■■□ 22.3
CDC42-202ENST00000344548 BEX3Q00994 111 aa14.71□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 MBTD1Q05BQ5 628 aa14.71□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 ZNF484Q5JVG2 852 aa14.71□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 MTHFD1LQ6UB35 978 aa14.71□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa14.71□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 ZNF662Q6ZS27 426 aa14.71□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 FZD8Q9H461 694 aa14.71□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 TMEM8AQ9HCN3 771 aa14.71□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 KCNG1Q9UIX4 513 aa14.71□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 COQ4Q9Y3A0 265 aa14.71□□□□□ -0.05
CDC42-202ENST00000344548 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa14.71□□□□□ -0.06
CDC42-202ENST00000344548 A6NJR5 290 aa14.71□□□□□ -0.06
CDC42-202ENST00000344548 TMEM88BA6NKF7 163 aa14.71□□□□□ -0.06
CDC42-202ENST00000344548 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.063e-12■■■□□ 16
CDC42-202ENST00000344548 P4HA2O15460 535 aa14.71□□□□□ -0.06
CDC42-202ENST00000344548 GAS2O43903 313 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
CDC42-202ENST00000344548 PTENP60484 403 aa14.71□□□□□ -0.06
CDC42-202ENST00000344548 DGKDQ16760 1214 aa14.71□□□□□ -0.06
CDC42-202ENST00000344548 PALB2Q86YC2 1186 aa14.71□□□□□ -0.06
CDC42-202ENST00000344548 TMEM192Q8IY95 271 aa14.71□□□□□ -0.06
CDC42-202ENST00000344548 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
CDC42-202ENST00000344548 TRPV1Q8NER1 839 aa14.71□□□□□ -0.06
CDC42-202ENST00000344548 OR5B17Q8NGF7 314 aa14.71□□□□□ -0.06
CDC42-202ENST00000344548 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
CDC42-202ENST00000344548 HELQQ8TDG4 1101 aa14.71□□□□□ -0.06
CDC42-202ENST00000344548 SYT11Q9BT88 431 aa14.71□□□□□ -0.06
CDC42-202ENST00000344548 SLC5A4Q9NY91 659 aa14.71□□□□□ -0.06
CDC42-202ENST00000344548 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
CDC42-202ENST00000344548 HDAC6Q9UBN7 1215 aa14.71□□□□□ -0.06
CDC42-202ENST00000344548 MYO6Q9UM54 1294 aa14.71□□□□□ -0.06
CDC42-202ENST00000344548 PMM2O15305 246 aa14.7□□□□□ -0.06
CDC42-202ENST00000344548 CLDN3O15551 220 aa14.7□□□□□ -0.06
CDC42-202ENST00000344548 CA12O43570 354 aa14.7□□□□□ -0.06
CDC42-202ENST00000344548 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CDC42-202ENST00000344548 TBC1D8O95759 1140 aa14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms