RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327347.9

SEPHS1-201, Transcript of selenophosphate synthetase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SEPHS1, Length 3,273 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPHS1-201ENST00000327347 SAAL1Q96ER3 474 aa18.47■□□□□ 0.55
SEPHS1-201ENST00000327347 TRIM7Q9C029 511 aa18.47■□□□□ 0.55
SEPHS1-201ENST00000327347 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa18.47■□□□□ 0.55
SEPHS1-201ENST00000327347 ASIC3Q9UHC3 531 aa18.47■□□□□ 0.55
SEPHS1-201ENST00000327347 CHRNA3P32297 505 aa18.47■□□□□ 0.55
SEPHS1-201ENST00000327347 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
SEPHS1-201ENST00000327347 KIF22Q14807 665 aa18.47■□□□□ 0.55
SEPHS1-201ENST00000327347 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
SEPHS1-201ENST00000327347 PADI6Q6TGC4 694 aa18.47■□□□□ 0.55
SEPHS1-201ENST00000327347 NACC1Q96RE7 527 aa18.47■□□□□ 0.55
SEPHS1-201ENST00000327347 FBXO28Q9NVF7 368 aa18.47■□□□□ 0.55
SEPHS1-201ENST00000327347 DMAC2Q9NW81 257 aa18.47■□□□□ 0.55
SEPHS1-201ENST00000327347 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP18.47■□□□□ 0.55
SEPHS1-201ENST00000327347 AGAP1Q9UPQ3 857 aa18.47■□□□□ 0.55
SEPHS1-201ENST00000327347 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
SEPHS1-201ENST00000327347 CSRNP1Q96S65 589 aa18.46■□□□□ 0.55
SEPHS1-201ENST00000327347 KIFC3Q9BVG8 833 aa18.46■□□□□ 0.55
SEPHS1-201ENST00000327347 NOD2Q9HC29 1040 aa18.46■□□□□ 0.55
SEPHS1-201ENST00000327347 AUHQ13825 339 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
SEPHS1-201ENST00000327347 TRIM68Q6AZZ1 485 aa18.46■□□□□ 0.55
SEPHS1-201ENST00000327347 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa18.46■□□□□ 0.55
SEPHS1-201ENST00000327347 NSMCE1Q8WV22 266 aa18.46■□□□□ 0.55
SEPHS1-201ENST00000327347 MKNK1Q9BUB5 465 aa18.46■□□□□ 0.55
SEPHS1-201ENST00000327347 TUFT1Q9NNX1 390 aa18.46■□□□□ 0.55
SEPHS1-201ENST00000327347 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
SEPHS1-201ENST00000327347 PNMA3Q9UL41 463 aa18.46■□□□□ 0.55
SEPHS1-201ENST00000327347 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
SEPHS1-201ENST00000327347 TCP11X1B4DZS4 312 aa18.45■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 CYP3A4P08684 503 aa18.45■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 POLR2MP0CAP2 368 aa18.45■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 CHKAP35790 457 aa18.45■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 GJC1P36383 396 aa18.45■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 COILP38432 576 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 STAT2P52630 851 aa18.45■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 MTM1Q13496 603 aa18.45■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 PRUNE1Q86TP1 453 aa18.45■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 CCDC63Q8NA47 563 aa18.45■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 PGM2Q96G03 612 aa18.45■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 MCM8Q9UJA3 840 aa18.45■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 TCP10L2B9ZVM9 353 aa18.45■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 CHRNB2P17787 502 aa18.45■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 CEP55Q53EZ4 464 aa18.45■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 RNF207Q6ZRF8 634 aa18.45■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 SLC26A4O43511 780 aa18.45■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 GH1P01241 217 aa18.45■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 PEX5P50542 639 aa18.45■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 C6orf118Q5T5N4 469 aa18.45■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 EXOC3L1Q86VI1 746 aa18.45■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 C3orf20Q8ND61 904 aa18.45■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 ZDHHC15Q96MV8 337 aa18.45■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 HEMGNQ9BXL5 484 aa18.45■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 PFASO15067 1338 aa18.44■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 CLRN2A0PK11 232 aa18.44■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 SLC16A4O15374 487 aa18.44■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 PPIP5K2O43314 1243 aa18.44■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 YY1P25490 414 aa18.44■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 CALCOCO2Q13137 446 aa18.44■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 GRIPAP1Q4V328 841 aa18.44■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 EPS8L1Q8TE68 723 aa18.44■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa18.44■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 MYH11P35749 1972 aa18.44■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 DIAPH2O60879 1101 aa18.44■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 PIAS1O75925 651 aa18.44■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 UBOX5O94941 541 aa18.44■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 ADCY2Q08462 1091 aa18.44■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 CETN1Q12798 172 aa18.44■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 ARMC9Q7Z3E5 817 aa18.44■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 KREMEN1Q96MU8 473 aa18.44■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 KDM4CQ9H3R0 1056 aa18.44■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 ENO4A6NNW6 628 aa18.43■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 PSEN1P49768 467 aa18.43■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 MXI1P50539 228 aa18.43■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 KRT17Q04695 432 aa18.43■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 KYNUQ16719 465 aa18.43■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 NUGGCQ68CJ6 796 aa18.43■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 FAM47EQ6ZV65 393 aa18.43■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa18.43■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 CBWD2Q8IUF1 395 aa18.43■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa18.43■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 SEMA4DQ92854 862 aa18.43■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 GMCL1Q96IK5 515 aa18.43■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 CHST7Q9NS84 486 aa18.43■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 HSPBP1Q9NZL4 362 aa18.43■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 MTUS1Q9ULD2 1270 aa18.43■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 TMEM120BA0PK00 339 aa18.43■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 CTNNA2P26232 953 aa18.43■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 XRCC4Q13426 336 aa18.43■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 CNGA2Q16280 664 aa18.43■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 TATDN1Q6P1N9 297 aa18.43■□□□□ 0.54
SEPHS1-201ENST00000327347 SLC5A5Q92911 643 aa18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.2 ms