RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 SNX17Q15036 470 aa22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 RPAINQ86UA6 219 aa22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 CDHR5Q9HBB8 845 aa22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 PTPRHQ9HD43 1115 aa22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 OGDHLQ9ULD0 1010 aa22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 ZBTB33Q86T24 672 aa22.56■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 TRIM49P0CI25 452 aa22.55■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 TRIM49CP0CI26 452 aa22.55■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 ACOT2P49753 483 aa22.55■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 TRIM14Q14142 442 aa22.55■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 CATSPER4Q7RTX7 472 aa22.55■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF333Q96JL9 665 aa22.55■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 MFSD14AQ96MC6 490 aa22.55■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 OGTO15294 1046 aa22.54■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 ENPEPQ07075 957 aa22.54■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 CYP24A1Q07973 514 aa22.54■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 PTK7Q13308 1070 aa22.54■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 EEF1DP3Q658K8 133 aa22.54■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 PPFIBP1Q86W92 1011 aa22.54■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC155Q8N6L0 562 aa22.54■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC43A3Q8NBI5 491 aa22.54■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 TMC2Q8TDI7 906 aa22.54■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM40Q8WWA1 233 aa22.54■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 WNT8BQ93098 351 aa22.54■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 CPB2Q96IY4 423 aa22.54■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa22.54■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 PDZD7Q9H5P4 517 aa22.54■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 TRPV2Q9Y5S1 764 aa22.54■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 TPM1P09493 284 aa22.54■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 FGFR4P22455 802 aa22.54■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 HS1BP3Q53T59 392 aa22.54■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC150Q8NCX0 1101 aa22.54■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 CDT1Q9H211 546 aa22.54■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 SIK3Q9Y2K2 1263 aa22.54■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 CDY2AQ9Y6F7 541 aa22.54■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 ARVCFO00192 962 aa22.53■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM189A1O60320 539 aa22.53■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 FMO5P49326 533 aa22.53■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 DLG4P78352 724 aa22.53■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 PARD3BQ8TEW8 1205 aa22.53■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC127Q96BQ5 260 aa22.53■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 ARMC5Q96C12 935 aa22.53■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 ADPGKQ9BRR6 497 aa22.53■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 NUP58Q9BVL2 599 aa22.53■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 MMRN2Q9H8L6 949 aa22.53■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 A0A1B0GUA9 196 aa22.52■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 STX10O60499 249 aa22.52■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 MCF2P10911 925 aa22.52■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 THPOP40225 353 aa22.52■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa22.52■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 PLEKHO2Q8TD55 490 aa22.52■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 IQCDQ96DY2 449 aa22.52■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 GYPCP04921 128 aa22.52■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 CTSHP09668 335 aa22.52■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 KLK7P49862 253 aa22.52■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 PSMD6Q15008 389 aa22.52■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 CRACR2AQ9BSW2 395 aa22.52■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa22.52■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 DLATP10515 647 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 AXLP30530 894 aa22.51■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 MYL7Q01449 175 aa22.51■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 RBL2Q08999 1139 aa22.51■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 KCNMA1Q12791 1236 aa22.51■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 EXOC3L4Q17RC7 722 aa22.51■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 SEZ6Q53EL9 994 aa22.51■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 FIGNQ5HY92 759 aa22.51■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 NOTUMQ6P988 496 aa22.51■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 THNSL1Q8IYQ7 743 aa22.51■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa22.51■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 CASP14P31944 242 aa22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 PPP3CAQ08209 521 aa22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 CETN1Q12798 172 aa22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 KYAT1Q16773 422 aa22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 CBWD6Q4V339 395 aa22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 CBWD3Q5JTY5 395 aa22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 CBWD5Q5RIA9 395 aa22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 C1orf220Q5T0J3 134 aa22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 GBP6Q6ZN66 633 aa22.5■■□□□ 1.19
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