RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 VN1R3Q9BXE9 311 aa8.81□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 C22orf23Q9BZE7 217 aa8.81□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 SEMA4GQ9NTN9 838 aa8.81□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 PPME1Q9Y570 386 aa8.81□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 VPS13AQ96RL7 3174 aa8.81□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP8.8□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 CACNA1GO43497 2377 aa8.8□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa8.8□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa8.8□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 ESYT2A0FGR8 921 aa8.8□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM205CA6NFA0 338 aa8.8□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 ASAP2O43150 1006 aa8.8□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 ZBTB43O43298 467 aa8.8□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRN2O75325 713 aa8.8□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 ECI2O75521 394 aa8.8□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 POU2F2P09086 479 aa8.8□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 SPATA31D3P0C874 917 aa8.8□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 MYBP10242 640 aa8.8□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 CLK2P49760 499 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 SHC2P98077 582 aa8.8□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 RNF20Q5VTR2 975 aa8.8□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 LRCH2Q5VUJ6 765 aa8.8□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 FUT10Q6P4F1 479 aa8.8□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 NOTUMQ6P988 496 aa8.8□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 AGMOQ6ZNB7 445 aa8.8□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa8.8□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 MIER3Q7Z3K6 550 aa8.8□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 COLGALT2Q8IYK4 626 aa8.8□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 TCP11Q8WWU5 503 aa8.8□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 IRF7Q92985 503 aa8.8□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 CHST7Q9NS84 486 aa8.8□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 GDE1Q9NZC3 331 aa8.8□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 V9GY48 417 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa8.79□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 CHMP2AO43633 222 aa8.79□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 MAFO75444 373 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 PROS1P07225 676 aa8.79□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 C8AP07357 584 aa8.79□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 TGM1P22735 817 aa8.79□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 TARSP26639 723 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 CIITAP33076 1130 aa8.79□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 CXCL12P48061 93 aa8.79□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 USP11P51784 963 aa8.79□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 LIMK1P53667 647 aa8.79□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 MTAPQ13126 283 aa8.79□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRC32Q14392 662 aa8.79□□□□□ -1
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PGGT1B-201ENST00000296642 MSANTD3Q96H12 275 aa8.79□□□□□ -1
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PGGT1B-201ENST00000296642 MARCH5Q9NX47 278 aa8.79□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 FBXW11Q9UKB1 542 aa8.79□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 ADAM28Q9UKQ2 775 aa8.79□□□□□ -1
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PGGT1B-201ENST00000296642 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa8.79□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 PATJQ8NI35 1801 aa8.79□□□□□ -1
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PGGT1B-201ENST00000296642 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa8.78□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 DOCK8Q8NF50 2099 aa8.78□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM8BA6NDV4 472 aa8.78□□□□□ -1
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PGGT1B-201ENST00000296642 MEIS3P2A8K0S8 358 aa8.78□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 DDX11L8A8MPP1 907 aa8.78□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF862O60290 1169 aa8.78□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 CD72P21854 359 aa8.78□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 PMLP29590 882 aa8.78□□□□□ -1
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PGGT1B-201ENST00000296642 RCAN1P53805 252 aa8.78□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 FGD1P98174 961 aa8.78□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 PTH1RQ03431 593 aa8.78□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 DSC1Q08554 894 aa8.78□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 GRIK3Q13003 919 aa8.78□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 TFDP1Q14186 410 aa8.78□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 LPAL2Q16609 132 aa8.78□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 LILRA6Q6PI73 481 aa8.78□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 OTUD6AQ7L8S5 288 aa8.78□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 LONP2Q86WA8 852 aa8.78□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 EXOC6Q8TAG9 804 aa8.78□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM200AQ8TCP9 573 aa8.78□□□□□ -1
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