RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293861.7

SNRNP25-201, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U11/U12 subunit 25, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene SNRNP25, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25-201ENST00000293861 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF446Q9NWS9 450 aa23.27■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa23.26■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 ADCY3O60266 1144 aa23.26■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 LRRN2O75325 713 aa23.26■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 MAPK4P31152 587 aa23.26■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 LAMC2Q13753 1193 aa23.26■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 CAPSQ13938 189 aa23.26■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 CST9Q5W186 159 aa23.26■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 TRIM50Q86XT4 487 aa23.26■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 FBXL13Q8NEE6 735 aa23.26■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 FAM213AQ9BRX8 229 aa23.26■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 CCDC151A5D8V7 595 aa23.25■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF185O15231 689 aa23.25■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 ARHGAP1Q07960 439 aa23.25■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 PSMD6Q15008 389 aa23.25■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 BRD3Q15059 726 aa23.25■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 TMCO3Q6UWJ1 677 aa23.25■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa23.25■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 SEMA4DQ92854 862 aa23.25■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 CAPZA3Q96KX2 299 aa23.25■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 GRID2IPA4D2P6 1211 aa23.25■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 ZBTB42B2RXF5 422 aa23.25■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 HBP1O60381 514 aa23.25■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP23.25■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 LDHAP00338 332 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 GH1P01241 217 aa23.25■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 MARK3P27448 753 aa23.25■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 MEI1Q5TIA1 1274 aa23.25■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 SV2AQ7L0J3 742 aa23.25■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 PLEKHH3Q7Z736 793 aa23.25■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 GLYCTKQ8IVS8 523 aa23.25■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 RAB20Q9NX57 234 aa23.25■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF236Q9UL36 1845 aa23.24■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP23.24■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 TNFAIP3P21580 790 aa23.24■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 EFNA5P52803 228 aa23.24■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 MFAP3P55082 362 aa23.24■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 FAM71AQ8IYT1 594 aa23.24■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 RNF14Q9UBS8 474 aa23.24■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 TRPM7Q96QT4 1865 aa23.24■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 HUNKP57058 714 aa23.23■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 NFRKBQ6P4R8 1299 aa23.23■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 ZPBP2Q6X784 338 aa23.23■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 DPP9Q86TI2 863 aa23.23■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 CAGE1Q8TC20 777 aa23.23■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 COG1Q8WTW3 980 aa23.23■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 SHC3Q92529 594 aa23.23■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 KREMEN1Q96MU8 473 aa23.23■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 AGPAT1Q99943 283 aa23.23■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 KATNBL1Q9H079 304 aa23.23■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa23.23■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 A0A0B4J269 797 aa23.23■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 ATP8B1O43520 1251 aa23.23■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 TMEM253P0C7T8 217 aa23.23■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 TMEM63BQ5T3F8 832 aa23.23■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 HELQQ8TDG4 1101 aa23.23■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 TAS1R2Q8TE23 839 aa23.23■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 FAM81BQ96LP2 452 aa23.23■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 NT5C1BQ96P26 610 aa23.23■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 HAPLN2Q9GZV7 340 aa23.23■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 NMRK2Q9NPI5 230 aa23.23■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 ERAP1Q9NZ08 941 aa23.23■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 NCANO14594 1321 aa23.22■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 ADGRA2Q96PE1 1338 aa23.22■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 NCK2O43639 380 aa23.22■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 GALCP54803 685 aa23.22■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 DRP2Q13474 957 aa23.22■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 LRRC57Q8N9N7 239 aa23.22■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 PPTC7Q8NI37 304 aa23.22■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 CCDC113Q9H0I3 377 aa23.22■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 FAM53CQ9NYF3 392 aa23.22■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 OGFRQ9NZT2 677 aa23.22■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 TRPC6Q9Y210 931 aa23.22■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 EVPLQ92817 2033 aa23.22■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 SLC15A5A6NIM6 579 aa23.21■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 DLATP10515 647 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 CHADLQ6NUI6 762 aa23.21■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa23.21■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 PPM1KQ8N3J5 372 aa23.21■■□□□ 1.31
SNRNP25-201ENST00000293861 LMBR1Q8WVP7 490 aa23.21■■□□□ 1.31
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