RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000271688.10

CERS2-201, Transcript of ceramide synthase 2, human

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CERS2, Length 2,544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CERS2-201	ENST00000271688	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		29.62	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	SHC3	Q92529	594 aa		29.62	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	29.62	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		29.62	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		29.62	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	MFAP3	P55082	362 aa		29.61	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		29.61	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		29.61	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		29.61	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	TATDN2	Q93075	761 aa		29.61	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	29.61	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		29.61	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		29.61	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	29.61	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	29.61	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	TNFAIP1	Q13829	316 aa		29.61	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		29.61	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	ERP44	Q9BS26	406 aa		29.61	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		29.61	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	USP20	Q9Y2K6	914 aa		29.61	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	EBAG9	O00559	213 aa		29.6	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	CYP11B1	P15538	503 aa		29.6	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	CORO7	P57737	925 aa		29.6	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	NUP85	Q9BW27	656 aa		29.6	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	TRPC6	Q9Y210	931 aa		29.6	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	SNX24	Q9Y343	169 aa		29.6	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	NDUFAB1	O14561	156 aa		29.6	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	DUPD1	Q68J44	220 aa		29.6	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		29.6	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	29.6	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	FMO2	Q99518	471 aa		29.6	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	RAB17	Q9H0T7	212 aa		29.6	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		29.6	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	29.59	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		29.59	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	RGS20	O76081	388 aa		29.59	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	PEX5	P50542	639 aa		29.59	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	LLGL1	Q15334	1064 aa		29.59	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	29.59	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	JAML	Q86YT9	394 aa		29.59	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	HACL1	Q9UJ83	578 aa		29.59	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	PMM2	O15305	246 aa		29.59	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	PYGM	P11217	842 aa		29.59	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	CCND2	P30279	289 aa		29.59	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	SEC24C	P53992	1094 aa		29.59	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	EMC10	Q5UCC4	262 aa		29.59	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	PRELID2	Q8N945	189 aa		29.59	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	MIF4GD	A9UHW6	222 aa	Known RBP	29.58	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	GZMA	P12544	262 aa		29.58	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	29.58	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		29.58	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	29.58	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	ZNF653	Q96CK0	615 aa		29.58	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	RAB20	Q9NX57	234 aa		29.58	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		29.58	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	PLTP	P55058	493 aa		29.58	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	MTMR3	Q13615	1198 aa		29.58	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	SV2A	Q7L0J3	742 aa		29.58	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		29.58	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	PIM2	Q9P1W9	311 aa		29.58	■■■□□ 2.33
CERS2-201	ENST00000271688	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		29.57	■■■□□ 2.32
CERS2-201	ENST00000271688	STBD1	O95210	358 aa		29.57	■■■□□ 2.32
CERS2-201	ENST00000271688	GPC3	P51654	580 aa		29.57	■■■□□ 2.32
CERS2-201	ENST00000271688	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	29.57	■■■□□ 2.32
CERS2-201	ENST00000271688	TCEAL1	Q15170	157 aa		29.57	■■■□□ 2.32
CERS2-201	ENST00000271688	TTC27	Q6P3X3	843 aa		29.57	■■■□□ 2.32
CERS2-201	ENST00000271688	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		29.57	■■■□□ 2.32
CERS2-201	ENST00000271688	NT5C1B	Q96P26	610 aa		29.57	■■■□□ 2.32
CERS2-201	ENST00000271688	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		29.57	■■■□□ 2.32
CERS2-201	ENST00000271688	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		29.57	■■■□□ 2.32
CERS2-201	ENST00000271688	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	29.56	■■■□□ 2.32
CERS2-201	ENST00000271688	BACE1	P56817	501 aa		29.56	■■■□□ 2.32
CERS2-201	ENST00000271688	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	29.56	■■■□□ 2.32
CERS2-201	ENST00000271688	CYP24A1	Q07973	514 aa		29.56	■■■□□ 2.32
CERS2-201	ENST00000271688	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	29.56	■■■□□ 2.32
CERS2-201	ENST00000271688	MICALL2	Q8IY33	904 aa		29.56	■■■□□ 2.32
CERS2-201	ENST00000271688	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		29.56	■■■□□ 2.32
CERS2-201	ENST00000271688	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		29.56	■■■□□ 2.32
CERS2-201	ENST00000271688	PARP14	Q460N5	1801 aa		29.56	■■■□□ 2.32
CERS2-201	ENST00000271688		A6NNZ2	444 aa		29.56	■■■□□ 2.32
CERS2-201	ENST00000271688	KCNA2	P16389	499 aa		29.56	■■■□□ 2.32
CERS2-201	ENST00000271688	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		29.56	■■■□□ 2.32
CERS2-201	ENST00000271688	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		29.56	■■■□□ 2.32
CERS2-201	ENST00000271688	MAGOHB	Q96A72	148 aa	Known RBP	29.56	■■■□□ 2.32
CERS2-201	ENST00000271688	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		29.56	■■■□□ 2.32
CERS2-201	ENST00000271688	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		29.56	■■■□□ 2.32
CERS2-201	ENST00000271688	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	29.56	■■■□□ 2.32
CERS2-201	ENST00000271688	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		29.56	■■■□□ 2.32
CERS2-201	ENST00000271688	SPOP	O43791	374 aa		29.55	■■■□□ 2.32
CERS2-201	ENST00000271688	PHF2	O75151	1096 aa		29.55	■■■□□ 2.32
CERS2-201	ENST00000271688	PTGIR	P43119	386 aa		29.55	■■■□□ 2.32
CERS2-201	ENST00000271688	PDE6C	P51160	858 aa		29.55	■■■□□ 2.32
CERS2-201	ENST00000271688	HMGCS2	P54868	508 aa		29.55	■■■□□ 2.32
CERS2-201	ENST00000271688	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	29.55	■■■□□ 2.32
CERS2-201	ENST00000271688	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		29.55	■■■□□ 2.32
CERS2-201	ENST00000271688	KIFAP3	Q92845	792 aa		29.55	■■■□□ 2.32
CERS2-201	ENST00000271688	CD101	Q93033	1021 aa		29.55	■■■□□ 2.32
CERS2-201	ENST00000271688	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		29.55	■■■□□ 2.32
CERS2-201	ENST00000271688	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	29.55	■■■□□ 2.32
CERS2-201	ENST00000271688	KRT5	P13647	590 aa		29.55	■■■□□ 2.32

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