RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 ATP5HO75947 161 aa9.47□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 TNNC2P02585 160 aa9.47□□□□□ -0.89
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HERC3-201ENST00000264345 CALB1P05937 261 aa9.47□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa9.47□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP9.47□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 COILP38432 576 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 TAP1Q03518 808 aa9.47□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 ITIH4Q14624 930 aa9.47□□□□□ -0.89
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HERC3-201ENST00000264345 RHOT1Q8IXI2 618 aa9.47□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 ATL2Q8NHH9 583 aa9.47□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 TXLNGQ9NUQ3 528 aa9.47□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 PLA2G6O60733 806 aa9.46□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 TJP3O95049 919 aa9.46□□□□□ -0.89
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HERC3-201ENST00000264345 COMTP21964 271 aa9.46□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 STAT4Q14765 748 aa9.46□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 FAM153CQ494X1 144 aa9.46□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 TMC3Q7Z5M5 1100 aa9.46□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.89
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HERC3-201ENST00000264345 HES6Q96HZ4 224 aa9.46□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 SMC6Q96SB8 1091 aa9.46□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 TRAIPQ9BWF2 469 aa9.46□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 WHRNQ9P202 907 aa9.46□□□□□ -0.89
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HERC3-201ENST00000264345 FAM153AQ9UHL3 310 aa9.46□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa9.46□□□□□ -0.89
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HERC3-201ENST00000264345 DRG2P55039 364 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 SP4Q02446 784 aa9.46□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 TUBB6Q9BUF5 446 aa9.46□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 KLC4Q9NSK0 619 aa9.46□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa9.46□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 ZNF148Q9UQR1 794 aa9.46□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa9.46□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 CYP26A1O43174 497 aa9.46□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 PSMD10O75832 226 aa9.46□□□□□ -0.9
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HERC3-201ENST00000264345 JAM2P57087 298 aa9.46□□□□□ -0.9
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HERC3-201ENST00000264345 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP9.46□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 RSAD2Q8WXG1 361 aa9.46□□□□□ -0.9
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HERC3-201ENST00000264345 RMDN3Q96TC7 470 aa9.46□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 DLEC1Q9Y238 1755 aa9.46□□□□□ -0.9
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HERC3-201ENST00000264345 MED7O43513 233 aa9.46□□□□□ -0.9
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HERC3-201ENST00000264345 NEDD9Q14511 834 aa9.46□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 ACAD10Q6JQN1 1059 aa9.46□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 CERS5Q8N5B7 392 aa9.46□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 SLC7A3Q8WY07 619 aa9.46□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 SERPINB12Q96P63 405 aa9.46□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 PRM3Q9NNZ6 103 aa9.46□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 VAV3Q9UKW4 847 aa9.46□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 SCN7AQ01118 1682 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 ANKRD65E5RJM6 399 aa9.45□□□□□ -0.9
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HERC3-201ENST00000264345 KRT17Q04695 432 aa9.45□□□□□ -0.9
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HERC3-201ENST00000264345 TKFCQ3LXA3 575 aa9.45□□□□□ -0.9
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HERC3-201ENST00000264345 PARP9Q8IXQ6 854 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 TTLL6Q8N841 843 aa9.45□□□□□ -0.9
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HERC3-201ENST00000264345 POLD4Q9HCU8 107 aa9.45□□□□□ -0.9
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HERC3-201ENST00000264345 ADAM22Q9P0K1 906 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 DGAT1O75907 488 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 FSBPO95073 299 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 RARGP13631 454 aa9.45□□□□□ -0.9
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HERC3-201ENST00000264345 DACT2Q5SW24 774 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 PCNX4Q63HM2 1172 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 DNAJC24Q6P3W2 148 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 C12orf56Q8IXR9 622 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 ARHGAP24Q8N264 748 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 TTC13Q8NBP0 860 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 LRRC8CQ8TDW0 803 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 PGM2Q96G03 612 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 KDM4CQ9H3R0 1056 aa9.45□□□□□ -0.9
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