RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262963.10

PTPRS-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRS, Length 4,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 KCND2Q9NZV8 630 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 UBR1Q8IWV7 1749 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 RASA4BC9J798 803 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF185O15231 689 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 RASA4O43374 803 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 TAP1Q03518 808 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 LRRC31Q6UY01 552 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 TRIM59Q8IWR1 403 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 REXO1L1PQ8IX06 675 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 TFR2Q9UP52 801 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 C19orf81C9J6K1 198 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 CRLF3Q8IUI8 442 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 NDUFAF2Q8N183 169 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 KCTD17Q8N5Z5 321 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 FAM151AQ8WW52 585 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 CTIFO43310 598 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 CHEK2O96017 543 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 MMEP08473 750 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP12.87□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 BCAR1P56945 870 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 EDRF1Q3B7T1 1238 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 SCN4BQ8IWT1 228 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 DAGLBQ8NCG7 672 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 SPATA4Q8NEY3 305 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 VCPKMTQ9H867 229 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 PCSK1NQ9UHG2 260 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 CYFIP1Q7L576 1253 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 ANKRD7Q92527 254 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 TRIM55Q9BYV6 548 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 IL17RBQ9NRM6 502 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 PDCLQ13371 301 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 TKFCQ3LXA3 575 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 FBXO41Q8TF61 875 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 AGPAT1Q99943 283 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 TTC36A6NLP5 189 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 DCTN3O75935 186 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 PMS2P54278 862 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 TMPRSS15P98073 1019 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 PDZD8Q8NEN9 1154 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF560Q96MR9 790 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 IQCA1LA6NCM1 817 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 TAC1P20366 129 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 MTMR2Q13614 643 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 TMTC4Q5T4D3 741 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 RNF149Q8NC42 400 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 TTC17Q96AE7 1141 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 FAM96AQ9H5X1 160 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 SNX12Q9UMY4 172 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 ART3Q13508 389 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 SLC18A3Q16572 532 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 RASIP1Q5U651 963 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 MAML1Q92585 1016 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 SERPINI1Q99574 410 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 KBTBD4Q9NVX7 518 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 A8MXQ7 604 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 TRIM67Q6ZTA4 783 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 STK33Q9BYT3 514 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 PARVAQ9NVD7 372 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 FIS1Q9Y3D6 152 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 SPDYE2BA6NHP3 402 aa12.85□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 NR3C2P08235 984 aa12.85□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 SPDYE6P0CI01 402 aa12.85□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 TXNP10599 105 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 CASP2P42575 452 aa12.85□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 ACAP3Q96P50 834 aa12.85□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 RTN2O75298 545 aa12.85□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 HSPA4LO95757 839 aa12.85□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 MYBP10242 640 aa12.85□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 SLC9A1P19634 815 aa12.85□□□□□ -0.35
PTPRS-201ENST00000262963 GRB10Q13322 594 aa12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms