RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256474.2

VHL-201, Transcript of von Hippel-Lindau tumor suppressor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VHL, Length 3,737 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VHL-201ENST00000256474 STRIP1Q5VSL9 837 aa14.49□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 CEP350Q5VT06 3117 aa14.49□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 SLFN11Q7Z7L1 901 aa14.49□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 RHOT2Q8IXI1 618 aa14.49□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 PLEKHO2Q8TD55 490 aa14.49□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 SEMA4DQ92854 862 aa14.49□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 FZD1Q9UP38 647 aa14.49□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 DENND3A2RUS2 1198 aa14.49□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 THAP12O43422 761 aa14.49□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 ECEL1O95672 775 aa14.49□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 MTMR1Q13613 665 aa14.49□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 RASA3Q14644 834 aa14.49□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 UGCGQ16739 394 aa14.49□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 DUPD1Q68J44 220 aa14.49□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 SPOPLQ6IQ16 392 aa14.49□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 MOXD1Q6UVY6 613 aa14.49□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 MBOAT7Q96N66 472 aa14.49□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa14.49□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 YWHABP31946 246 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 SCTRP47872 440 aa14.48□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 PPATQ06203 517 aa14.48□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 LARGE2Q8N3Y3 721 aa14.48□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 RASGEF1CQ8N431 466 aa14.48□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 VCPKMTQ9H867 229 aa14.48□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 CHST7Q9NS84 486 aa14.48□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 COL20A1Q9P218 1284 aa14.48□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa14.48□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 TCP11X1B4DZS4 312 aa14.48□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 CIITAP33076 1130 aa14.48□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 CRYGNQ8WXF5 182 aa14.48□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 BORCS6Q96GS4 357 aa14.48□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa14.48□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 IFNB1P01574 187 aa14.48□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 CD58P19256 250 aa14.48□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 VCAM1P19320 739 aa14.48□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 BMT2Q1RMZ1 405 aa14.48□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 TATDN1Q6P1N9 297 aa14.48□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 C11orf70Q9BRQ4 267 aa14.48□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 PASKQ96RG2 1323 aa14.47□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 ATP9AO75110 1047 aa14.47□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 CYB5D1Q6P9G0 228 aa14.47□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 CEP170P1Q96L14 293 aa14.47□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 NT5C1BQ96P26 610 aa14.47□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 TAAR1Q96RJ0 339 aa14.47□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 BTNL10A8MVZ5 291 aa14.47□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 ACOT2P49753 483 aa14.47□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 RWDD2BP57060 319 aa14.47□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 PRKG1Q13976 671 aa14.47□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 SNCBQ16143 134 aa14.47□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa14.47□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 AGBL2Q5U5Z8 902 aa14.47□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 CNPY4Q8N129 248 aa14.47□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 EPS8L1Q8TE68 723 aa14.47□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 KREMEN1Q96MU8 473 aa14.47□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 FIZ1Q96SL8 496 aa14.47□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa14.47□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 O00370 1275 aa14.46□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 CHKAP35790 457 aa14.46□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 COILP38432 576 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 QARSP47897 775 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 FNTAP49354 379 aa14.46□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa14.46□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 ZDHHC24Q6UX98 284 aa14.46□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 CCDC91Q7Z6B0 441 aa14.46□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa14.46□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 SLC5A5Q92911 643 aa14.46□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 MXRA8Q9BRK3 442 aa14.46□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 KMT5AQ9NQR1 393 aa14.46□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 FRMPD4Q14CM0 1322 aa14.46□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 GOLGA8SH3BPF8 625 aa14.46□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 GOLGA8MH3BSY2 632 aa14.46□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 RTN2O75298 545 aa14.46□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 SPAG7O75391 227 aa14.46□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 P4HBP07237 508 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 CHRNA3P32297 505 aa14.46□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 RARRES1P49788 294 aa14.46□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 MFAP3P55082 362 aa14.46□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 SYCP2LQ5T4T6 812 aa14.46□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 ZNF365Q70YC5 407 aa14.46□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 KRT27Q7Z3Y8 459 aa14.46□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 ABCF3Q9NUQ8 709 aa14.46□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 GH1P01241 217 aa14.46□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 DRD4P21917 467 aa14.46□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
VHL-201ENST00000256474 PPP2R5AQ15172 486 aa14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 307.7 ms